Protein–RNA interactions for Protein: P53758

YNR077C, UPF0320 protein YNR077C, yeastyeast

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR077CP53758 DUS1YML080W 1272 nt7.83□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 TRM5YHR070W 1500 nt7.8□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 FTR1YER145C 1215 nt7.8□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 MXR2YCL033C 507 nt7.78□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 YCL042WYCL042W 360 nt7.78□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 GAL1YBR020W 1587 nt7.78□□□□□ -1.16
YNR077CP53758 BNA2YJR078W 1362 nt7.77□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt7.77□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 YLR281CYLR281C 468 nt7.77□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 DDR2YOL052C-A 186 nt7.77□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 MIC12YBR262C 321 nt7.76□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 NDI1YML120C 1542 nt7.76□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 IMP2'YIL154C 1041 nt7.75□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 ANP1YEL036C 1503 nt7.74□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.74□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.74□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 YKL097CYKL097C 411 nt7.73□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN37-1RDN37-1 5354 nt7.73□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN37-2RDN37-2 5354 nt7.73□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN18-1RDN18-1 1800 nt7.73□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 RDN18-2RDN18-2 1800 nt7.73□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 YDR433WYDR433W 441 nt7.72□□□□□ -1.17
YNR077CP53758 HHO1YPL127C 777 nt7.69□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 FRD1YEL047C 1413 nt7.69□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 FMP45YDL222C 930 nt7.68□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 XDJ1YLR090W 1380 nt7.67□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 SPT20YOL148C 1815 nt7.66□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 HEL2YDR266C 1920 nt7.66□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 DIC1YLR348C 897 nt7.66□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 STR3YGL184C 1398 nt7.66□□□□□ -1.18
YNR077CP53758 FEN2YCR028C 1539 nt7.62□□□□□ -1.19
YNR077CP53758 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.62□□□□□ -1.19
YNR077CP53758 RPC82YPR190C 1965 nt7.62□□□□□ -1.19
YNR077CP53758 DUT1YBR252W 444 nt7.61□□□□□ -1.19
YNR077CP53758 STB1YNL309W 1263 nt7.6□□□□□ -1.19
YNR077CP53758 SPC25YER018C 666 nt7.58□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 YOR139CYOR139C 393 nt7.58□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 YPR011CYPR011C 981 nt7.58□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 AQY1YPR192W 918 nt7.58□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 YGR201CYGR201C 678 nt7.57□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 YIR016WYIR016W 798 nt7.57□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 AQY2YLL052C 450 nt7.57□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 INA1YLR413W 2028 nt7.57□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 GDH3YAL062W 1374 nt7.57□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 RIM8YGL045W 1629 nt7.56□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 RTN2YDL204W 1182 nt7.55□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 ERV46YAL042W 1248 nt7.55□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 YKR040CYKR040C 504 nt7.55□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 LPX1YOR084W 1164 nt7.54□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 GPI16YHR188C 1833 nt7.54□□□□□ -1.2
YNR077CP53758 VPS60YDR486C 690 nt7.51□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 PUS2YGL063W 1113 nt7.5□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 ALG3YBL082C 1377 nt7.49□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 HIF1YLL022C 1158 nt7.49□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 MUP1YGR055W 1725 nt7.49□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 YGL114WYGL114W 2178 nt7.48□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 AVT6YER119C 1347 nt7.47□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 CCT4YDL143W 1587 nt7.46□□□□□ -1.21
YNR077CP53758 GOR1YNL274C 1053 nt7.45□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 ALD4YOR374W 1560 nt7.42□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 PRM5YIL117C 957 nt7.42□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 YLR179CYLR179C 606 nt7.42□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 TIM23YNR017W 669 nt7.42□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 PLB1YMR008C 1995 nt7.41□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 SWC5YBR231C 912 nt7.41□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 MAE1YKL029C 2010 nt7.4□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 PTH1YHR189W 573 nt7.4□□□□□ -1.22
YNR077CP53758 HOL1YNR055C 1761 nt7.4□□□□□ -1.23
YNR077CP53758 AHT1YHR093W 549 nt7.37□□□□□ -1.23
YNR077CP53758 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt7.33□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 IMT4tM(CAU)E 72 nt7.33□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 IMT3tM(CAU)J3 72 nt7.33□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 IMT1tM(CAU)O1 72 nt7.33□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 IMT2tM(CAU)P 72 nt7.33□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 ARP6YLR085C 1317 nt7.32□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 YLR235CYLR235C 399 nt7.32□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 ZRT3YKL175W 1512 nt7.31□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 MET2YNL277W 1461 nt7.29□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 ACO2YJL200C 2370 nt7.28□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 NBP35YGL091C 987 nt7.28□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 YJL067WYJL067W 351 nt7.28□□□□□ -1.24
YNR077CP53758 UTR1YJR049C 1593 nt7.27□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 SFP1YLR403W 2052 nt7.26□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 SHM2YLR058C 1410 nt7.26□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 YMR209CYMR209C 1374 nt7.25□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 YNL024CYNL024C 741 nt7.25□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 DAT1YML113W 747 nt7.24□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 YOR325WYOR325W 474 nt7.23□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 YPR064WYPR064W 420 nt7.23□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 ILV3YJR016C 1758 nt7.23□□□□□ -1.25
YNR077CP53758 NIT1YIL164C 600 nt7.19□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 UGP1YKL035W 1500 nt7.18□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 YCR102CYCR102C 1107 nt7.18□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 TAD3YLR316C 969 nt7.18□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 RPM1RPM1 483 nt7.18□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 SPP1YPL138C 1062 nt7.18□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 HIS2YFR025C 1008 nt7.16□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 SAM35YHR083W 990 nt7.16□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 BDH1YAL060W 1149 nt7.16□□□□□ -1.26
YNR077CP53758 COQ8YGL119W 1506 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.4 ms