Protein–RNA interactions for Protein: P43601

ATG18, Autophagy-related protein 18, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG18P43601 TRM5YHR070W 1500 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG18P43601 YKR040CYKR040C 504 nt9.76□□□□□ -0.85
ATG18P43601 LPX1YOR084W 1164 nt9.76□□□□□ -0.85
ATG18P43601 DIC1YLR348C 897 nt9.75□□□□□ -0.85
ATG18P43601 DDR2YOL052C-A 186 nt9.75□□□□□ -0.85
ATG18P43601 BMT6YLR063W 1098 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG18P43601 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.72□□□□□ -0.85
ATG18P43601 YKR005CYKR005C 1578 nt9.71□□□□□ -0.85
ATG18P43601 BNA2YJR078W 1362 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG18P43601 NAR1YNL240C 1476 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG18P43601 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 ANP1YEL036C 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 WSC2YNL283C 1512 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG18P43601 MIC12YBR262C 321 nt9.68□□□□□ -0.86
ATG18P43601 AQY1YPR192W 918 nt9.67□□□□□ -0.86
ATG18P43601 AGP1YCL025C 1902 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG18P43601 SNF1YDR477W 1902 nt9.65□□□□□ -0.86
ATG18P43601 BIO5YNR056C 1686 nt9.64□□□□□ -0.87
ATG18P43601 YCL074WYCL074W 927 nt9.64□□□□□ -0.87
ATG18P43601 DUS1YML080W 1272 nt9.63□□□□□ -0.87
ATG18P43601 YGR259CYGR259C 441 nt9.61□□□□□ -0.87
ATG18P43601 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG18P43601 STB1YNL309W 1263 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG18P43601 PBP1YGR178C 2169 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG18P43601 SPC25YER018C 666 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG18P43601 FEN2YCR028C 1539 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG18P43601 IRC24YIR036C 792 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG18P43601 GPI16YHR188C 1833 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG18P43601 CYT2YKL087C 675 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG18P43601 HHO1YPL127C 777 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG18P43601 YGR201CYGR201C 678 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG18P43601 TIM23YNR017W 669 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG18P43601 VPS60YDR486C 690 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG18P43601 YIR016WYIR016W 798 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG18P43601 YLR179CYLR179C 606 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG18P43601 YLR235CYLR235C 399 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG18P43601 XDJ1YLR090W 1380 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG18P43601 PTH1YHR189W 573 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG18P43601 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.46□□□□□ -0.9
ATG18P43601 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.46□□□□□ -0.9
ATG18P43601 CCT4YDL143W 1587 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG18P43601 STR3YGL184C 1398 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG18P43601 ALG3YBL082C 1377 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG18P43601 SWC5YBR231C 912 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG18P43601 AHT1YHR093W 549 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG18P43601 DUT1YBR252W 444 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG18P43601 MOT3YMR070W 1473 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG18P43601 RTN2YDL204W 1182 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG18P43601 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
ATG18P43601 AQY2YLL052C 450 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG18P43601 YPR064WYPR064W 420 nt9.33□□□□□ -0.92
ATG18P43601 GOR1YNL274C 1053 nt9.32□□□□□ -0.92
ATG18P43601 SPP1YPL138C 1062 nt9.32□□□□□ -0.92
ATG18P43601 AVT6YER119C 1347 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG18P43601 YKL030WYKL030W 606 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG18P43601 YAT1YAR035W 2064 nt9.3□□□□□ -0.92
ATG18P43601 GDH3YAL062W 1374 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG18P43601 NDI1YML120C 1542 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG18P43601 TAD3YLR316C 969 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG18P43601 HSL7YBR133C 2484 nt9.21□□□□□ -0.94
ATG18P43601 SHM2YLR058C 1410 nt9.17□□□□□ -0.94
ATG18P43601 BDH1YAL060W 1149 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG18P43601 DAT1YML113W 747 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG18P43601 PLB1YMR008C 1995 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG18P43601 YLR415CYLR415C 339 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG18P43601 SPT20YOL148C 1815 nt9.13□□□□□ -0.95
ATG18P43601 TIM17YJL143W 477 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG18P43601 HIF1YLL022C 1158 nt9.12□□□□□ -0.95
ATG18P43601 ARP6YLR085C 1317 nt9.11□□□□□ -0.95
ATG18P43601 ALD4YOR374W 1560 nt9.1□□□□□ -0.95
ATG18P43601 INA1YLR413W 2028 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG18P43601 PRM5YIL117C 957 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG18P43601 RPC82YPR190C 1965 nt9.09□□□□□ -0.95
ATG18P43601 NBP35YGL091C 987 nt9.08□□□□□ -0.96
ATG18P43601 YCR102CYCR102C 1107 nt9.07□□□□□ -0.96
ATG18P43601 NIT1YIL164C 600 nt9.07□□□□□ -0.96
ATG18P43601 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.05□□□□□ -0.96
ATG18P43601 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG18P43601 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.02□□□□□ -0.97
ATG18P43601 YSP3YOR003W 1437 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG18P43601 SGT2YOR007C 1041 nt9.01□□□□□ -0.97
ATG18P43601 UTR1YJR049C 1593 nt8.98□□□□□ -0.97
ATG18P43601 SAM35YHR083W 990 nt8.96□□□□□ -0.98
ATG18P43601 ZRT3YKL175W 1512 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG18P43601 RTG1YOL067C 534 nt8.95□□□□□ -0.98
ATG18P43601 LSC2YGR244C 1284 nt8.93□□□□□ -0.98
ATG18P43601 GAP1YKR039W 1809 nt8.92□□□□□ -0.98
ATG18P43601 TIR3YIL011W 810 nt8.91□□□□□ -0.98
ATG18P43601 YNL115CYNL115C 1935 nt8.89□□□□□ -0.99
ATG18P43601 HEL2YDR266C 1920 nt8.87□□□□□ -0.99
ATG18P43601 RIM8YGL045W 1629 nt8.86□□□□□ -0.99
ATG18P43601 PEX25YPL112C 1185 nt8.85□□□□□ -0.99
ATG18P43601 PRO1YDR300C 1287 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG18P43601 YJL067WYJL067W 351 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG18P43601 VPS75YNL246W 795 nt8.84□□□□□ -0.99
ATG18P43601 YGL114WYGL114W 2178 nt8.83□□□□□ -1
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