Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANBP1P43487 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP1P43487 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP1P43487 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANBP1P43487 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANBP1P43487 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANBP1P43487 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANBP1P43487 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP1P43487 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANBP1P43487 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANBP1P43487 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANBP1P43487 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RANBP1P43487 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RANBP1P43487 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANBP1P43487 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP1P43487 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP1P43487 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RANBP1P43487 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANBP1P43487 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANBP1P43487 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RANBP1P43487 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms