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Protein–RNA interactions for Protein: P39968
VAC8, Vacuolar protein 8, yeast
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578 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAC8
P39968
DDR2
YOL052C-A
186 nt
11.15
□□□□□ -0.62
VAC8
P39968
RTF1
YGL244W
1677 nt
11.13
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
STB1
YNL309W
1263 nt
11.12
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
NCP1
YHR042W
2076 nt
11.12
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
ATF2
YGR177C
1608 nt
11.11
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
CRR1
YLR213C
1269 nt
11.11
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
SPC25
YER018C
666 nt
11.1
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
YFR018C
YFR018C
1092 nt
11.1
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
GPI16
YHR188C
1833 nt
11.09
□□□□□ -0.63
VAC8
P39968
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
11.08
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
YJL225C
YJL225C
5277 nt
11.07
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
11.06
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
CCT4
YDL143W
1587 nt
11.06
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
RRT5
YFR032C
870 nt
11.05
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
HEM12
YDR047W
1089 nt
11.03
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
YLR415C
YLR415C
339 nt
11.03
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
SWC5
YBR231C
912 nt
11.03
□□□□□ -0.64
VAC8
P39968
PIB2
YGL023C
1908 nt
11
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
LYS4
YDR234W
2082 nt
11
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
BDH1
YAL060W
1149 nt
10.99
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
Q0010
Q0010
387 nt
10.99
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
ANP1
YEL036C
1503 nt
10.99
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
SNG1
YGR197C
1644 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
VPS60
YDR486C
690 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
PAU16
YKL224C
372 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
PEX25
YPL112C
1185 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
FEN2
YCR028C
1539 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAC8
P39968
YSP3
YOR003W
1437 nt
10.95
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
YFL015W-A
YFL015W-A
318 nt
10.95
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
PRE6
YOL038W
765 nt
10.94
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
MIC10
YCL057C-A
294 nt
10.93
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
MET8
YBR213W
825 nt
10.92
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
YNL115C
YNL115C
1935 nt
10.92
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
ALG3
YBL082C
1377 nt
10.9
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
YFL066C
YFL066C
1179 nt
10.9
□□□□□ -0.66
VAC8
P39968
PTK1
YKL198C
1989 nt
10.89
□□□□□ -0.67
VAC8
P39968
YIR016W
YIR016W
798 nt
10.87
□□□□□ -0.67
VAC8
P39968
CLB6
YGR109C
1143 nt
10.86
□□□□□ -0.67
VAC8
P39968
BNA2
YJR078W
1362 nt
10.86
□□□□□ -0.67
VAC8
P39968
YHR056W-A
YHR056W-A
435 nt
10.84
□□□□□ -0.67
VAC8
P39968
SPT8
YLR055C
1809 nt
10.83
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
PAC11
YDR488C
1602 nt
10.83
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
VPS75
YNL246W
795 nt
10.82
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
YJR154W
YJR154W
1041 nt
10.81
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
YFL054C
YFL054C
1941 nt
10.8
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
TIM17
YJL143W
477 nt
10.8
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
RAX1
YOR301W
1308 nt
10.8
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
NAT4
YMR069W
858 nt
10.78
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
10.78
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
10.78
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
GLK1
YCL040W
1503 nt
10.78
□□□□□ -0.68
VAC8
P39968
YGR139W
YGR139W
339 nt
10.74
□□□□□ -0.69
VAC8
P39968
MIC12
YBR262C
321 nt
10.74
□□□□□ -0.69
VAC8
P39968
PAU7
YAR020C
168 nt
10.72
□□□□□ -0.69
VAC8
P39968
XDJ1
YLR090W
1380 nt
10.71
□□□□□ -0.69
VAC8
P39968
YGR201C
YGR201C
678 nt
10.69
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
HHO1
YPL127C
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10.69
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
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YLR058C
1410 nt
10.68
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
MIR1
YJR077C
936 nt
10.68
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
THI74
YDR438W
1113 nt
10.67
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
MSF1
YPR047W
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10.65
□□□□□ -0.7
VAC8
P39968
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YAL062W
1374 nt
10.65
□□□□□ -0.71
VAC8
P39968
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YDR510C-A
117 nt
10.64
□□□□□ -0.71
VAC8
P39968
NVJ2
YPR091C
2313 nt
10.64
□□□□□ -0.71
VAC8
P39968
BSP1
YPR171W
1731 nt
10.58
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
SGT2
YOR007C
1041 nt
10.58
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
AVT6
YER119C
1347 nt
10.57
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
NIT1
YIL164C
600 nt
10.55
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
GOR1
YNL274C
1053 nt
10.55
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
SWE1
YJL187C
2460 nt
10.54
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
SBA1
YKL117W
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10.54
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
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YKR043C
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10.54
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
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YML113W
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10.54
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
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YER168C
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10.54
□□□□□ -0.72
VAC8
P39968
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YHR111W
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VAC8
P39968
YSR3
YKR053C
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10.49
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VAC8
P39968
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YGL034C
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VAC8
P39968
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VAC8
P39968
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YDR010C
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VAC8
P39968
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YCR087W
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VAC8
P39968
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YCR102C
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10.44
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VAC8
P39968
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10.44
□□□□□ -0.74
VAC8
P39968
DUS1
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1272 nt
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VAC8
P39968
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YBR296C
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VAC8
P39968
CSM2
YIL132C
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□□□□□ -0.75
VAC8
P39968
XYL2
YLR070C
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VAC8
P39968
RSC4
YKR008W
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VAC8
P39968
DUT1
YBR252W
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10.37
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VAC8
P39968
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YPL042C
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10.37
□□□□□ -0.75
VAC8
P39968
PAB1
YER165W
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10.35
□□□□□ -0.75
VAC8
P39968
NDI1
YML120C
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10.34
□□□□□ -0.75
VAC8
P39968
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YDR405W
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□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
MAS1
YLR163C
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10.33
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
GLR1
YPL091W
1452 nt
10.32
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
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YAL036C
1110 nt
10.32
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
AIM45
YPR004C
1035 nt
10.32
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
YCL074W
YCL074W
927 nt
10.31
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
AQY2
YLL052C
450 nt
10.28
□□□□□ -0.76
VAC8
P39968
NBP35
YGL091C
987 nt
10.27
□□□□□ -0.77
VAC8
P39968
YMR244W
YMR244W
1068 nt
10.27
□□□□□ -0.77
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