Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 RPP2AYOL039W 321 nt12.98□□□□□ -0.33
SSP1P38871 GET2YER083C 858 nt12.97□□□□□ -0.33
SSP1P38871 MPS2YGL075C 1164 nt12.97□□□□□ -0.33
SSP1P38871 PEX27YOR193W 1131 nt12.97□□□□□ -0.33
SSP1P38871 UBC12YLR306W 567 nt12.96□□□□□ -0.33
SSP1P38871 YLR281CYLR281C 468 nt12.95□□□□□ -0.34
SSP1P38871 YSP3YOR003W 1437 nt12.95□□□□□ -0.34
SSP1P38871 COX3Q0275 810 nt12.94□□□□□ -0.34
SSP1P38871 ARC19YKL013C 516 nt12.94□□□□□ -0.34
SSP1P38871 CAC2YML102W 1407 nt12.93□□□□□ -0.34
SSP1P38871 YMR090WYMR090W 684 nt12.92□□□□□ -0.34
SSP1P38871 SUA5YGL169W 1281 nt12.91□□□□□ -0.34
SSP1P38871 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SSP1P38871 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.91□□□□□ -0.34
SSP1P38871 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt12.91□□□□□ -0.34
SSP1P38871 SIS1YNL007C 1059 nt12.91□□□□□ -0.34
SSP1P38871 YDL221WYDL221W 552 nt12.9□□□□□ -0.34
SSP1P38871 YBR220CYBR220C 1683 nt12.89□□□□□ -0.35
SSP1P38871 PUS2YGL063W 1113 nt12.89□□□□□ -0.35
SSP1P38871 YLR311CYLR311C 348 nt12.89□□□□□ -0.35
SSP1P38871 WHI5YOR083W 888 nt12.89□□□□□ -0.35
SSP1P38871 ARP6YLR085C 1317 nt12.88□□□□□ -0.35
SSP1P38871 NAS6YGR232W 687 nt12.88□□□□□ -0.35
SSP1P38871 EEB1YPL095C 1371 nt12.88□□□□□ -0.35
SSP1P38871 YJL211CYJL211C 444 nt12.87□□□□□ -0.35
SSP1P38871 PCL10YGL134W 1302 nt12.86□□□□□ -0.35
SSP1P38871 TAT1YBR069C 1860 nt12.85□□□□□ -0.35
SSP1P38871 TAF4YMR005W 1167 nt12.84□□□□□ -0.35
SSP1P38871 NDJ1YOL104C 1059 nt12.81□□□□□ -0.36
SSP1P38871 Q0017Q0017 162 nt12.8□□□□□ -0.36
SSP1P38871 SDH1YKL148C 1923 nt12.8□□□□□ -0.36
SSP1P38871 MRS3YJL133W 945 nt12.79□□□□□ -0.36
SSP1P38871 SIR2YDL042C 1689 nt12.78□□□□□ -0.36
SSP1P38871 MMS21YEL019C 804 nt12.78□□□□□ -0.36
SSP1P38871 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.78□□□□□ -0.36
SSP1P38871 YHL044WYHL044W 708 nt12.77□□□□□ -0.37
SSP1P38871 YNL165WYNL165W 1221 nt12.77□□□□□ -0.37
SSP1P38871 GAT1YFL021W 1533 nt12.77□□□□□ -0.37
SSP1P38871 YDL157CYDL157C 357 nt12.76□□□□□ -0.37
SSP1P38871 DIA1YMR316W 1011 nt12.76□□□□□ -0.37
SSP1P38871 COA2YPL189C-A 207 nt12.76□□□□□ -0.37
SSP1P38871 AQY1YPR192W 918 nt12.76□□□□□ -0.37
SSP1P38871 VPS28YPL065W 729 nt12.75□□□□□ -0.37
SSP1P38871 RSC4YKR008W 1878 nt12.74□□□□□ -0.37
SSP1P38871 IRC15YPL017C 1500 nt12.74□□□□□ -0.37
SSP1P38871 RUF21RUF21 707 nt12.73□□□□□ -0.37
SSP1P38871 NVJ2YPR091C 2313 nt12.72□□□□□ -0.37
SSP1P38871 PHO92YDR374C 921 nt12.72□□□□□ -0.37
SSP1P38871 NEJ1YLR265C 1029 nt12.72□□□□□ -0.37
SSP1P38871 AME1YBR211C 975 nt12.72□□□□□ -0.37
SSP1P38871 MRI1YPR118W 1236 nt12.71□□□□□ -0.37
SSP1P38871 PEX34YCL056C 435 nt12.71□□□□□ -0.37
SSP1P38871 ART5YGR068C 1761 nt12.71□□□□□ -0.38
SSP1P38871 GFD2YCL036W 1701 nt12.71□□□□□ -0.38
SSP1P38871 CTR1YPR124W 1221 nt12.69□□□□□ -0.38
SSP1P38871 RRP1YDR087C 837 nt12.68□□□□□ -0.38
SSP1P38871 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt12.68□□□□□ -0.38
SSP1P38871 GTT3YEL017W 1014 nt12.68□□□□□ -0.38
SSP1P38871 YMR074CYMR074C 438 nt12.68□□□□□ -0.38
SSP1P38871 IMP2'YIL154C 1041 nt12.67□□□□□ -0.38
SSP1P38871 TIF34YMR146C 1044 nt12.67□□□□□ -0.38
SSP1P38871 SCC4YER147C 1875 nt12.67□□□□□ -0.38
SSP1P38871 YPR1YDR368W 939 nt12.66□□□□□ -0.38
SSP1P38871 RMA1YKL132C 1293 nt12.66□□□□□ -0.38
SSP1P38871 DSK2YMR276W 1122 nt12.66□□□□□ -0.38
SSP1P38871 PZF1YPR186C 1290 nt12.66□□□□□ -0.38
SSP1P38871 YER147C-AYER147C-A 411 nt12.65□□□□□ -0.38
SSP1P38871 TSR2YLR435W 618 nt12.65□□□□□ -0.38
SSP1P38871 GIS3YLR094C 1509 nt12.65□□□□□ -0.38
SSP1P38871 YJL152WYJL152W 360 nt12.64□□□□□ -0.39
SSP1P38871 PET9YBL030C 957 nt12.64□□□□□ -0.39
SSP1P38871 OCA1YNL099C 717 nt12.63□□□□□ -0.39
SSP1P38871 YPR150WYPR150W 522 nt12.62□□□□□ -0.39
SSP1P38871 YJR056CYJR056C 711 nt12.61□□□□□ -0.39
SSP1P38871 FAR3YMR052W 615 nt12.61□□□□□ -0.39
SSP1P38871 XDJ1YLR090W 1380 nt12.6□□□□□ -0.39
SSP1P38871 MIX17YMR002W 471 nt12.59□□□□□ -0.39
SSP1P38871 CWC25YNL245C 540 nt12.58□□□□□ -0.4
SSP1P38871 TIR4YOR009W 1464 nt12.58□□□□□ -0.4
SSP1P38871 ALG7YBR243C 1347 nt12.58□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YNL040WYNL040W 1371 nt12.57□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YCH1YGR203W 447 nt12.57□□□□□ -0.4
SSP1P38871 FMP45YDL222C 930 nt12.56□□□□□ -0.4
SSP1P38871 RPM1RPM1 483 nt12.56□□□□□ -0.4
SSP1P38871 RTS2YOR077W 699 nt12.56□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YHR054CYHR054C 1065 nt12.55□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YLR236CYLR236C 324 nt12.55□□□□□ -0.4
SSP1P38871 PEX12YMR026C 1200 nt12.55□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YMR114CYMR114C 1107 nt12.55□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YDL158CYDL158C 309 nt12.53□□□□□ -0.4
SSP1P38871 LYS12YIL094C 1116 nt12.53□□□□□ -0.4
SSP1P38871 YPR011CYPR011C 981 nt12.53□□□□□ -0.4
SSP1P38871 DSE3YOR264W 1293 nt12.52□□□□□ -0.41
SSP1P38871 PRE2YPR103W 864 nt12.5□□□□□ -0.41
SSP1P38871 TAZ1YPR140W 1146 nt12.5□□□□□ -0.41
SSP1P38871 MAF1YDR005C 1188 nt12.49□□□□□ -0.41
SSP1P38871 IDH1YNL037C 1083 nt12.49□□□□□ -0.41
SSP1P38871 SVF1YDR346C 1446 nt12.48□□□□□ -0.41
SSP1P38871 YLR283WYLR283W 945 nt12.48□□□□□ -0.41
SSP1P38871 CUE1YMR264W 612 nt12.48□□□□□ -0.41
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