Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 C19orf12-202ENST00000342680 578 ntTSL 521.01■□□□□ 0.952e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 SPATS2-205ENST00000548388 564 ntTSL 219.69■□□□□ 0.742e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 SPATS2-219ENST00000552171 465 ntTSL 519.69■□□□□ 0.742e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 518.34■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 77.4
GTF2F1P35269 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 216.89■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 77.4
GTF2F1P35269 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 77.4
GTF2F1P35269 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 77.4
GTF2F1P35269 RNF182-202ENST00000423553 633 ntTSL 225.03■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-203ENST00000471906 557 ntTSL 424.36■■□□□ 1.492e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-204ENST00000488300 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-201ENST00000420478 826 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-205ENST00000488763 646 ntTSL 46.5□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.472e-11■■■■■ 77.2
GTF2F1P35269 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 520.35■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 75.6
GTF2F1P35269 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 519.88■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 75.6
GTF2F1P35269 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 75.6
GTF2F1P35269 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 319.13■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 75.4
GTF2F1P35269 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 318.85■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 75.4
GTF2F1P35269 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-9■■■■■ 75.4
GTF2F1P35269 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.439e-19■■■■■ 75
GTF2F1P35269 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.789e-19■■■■■ 75
GTF2F1P35269 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.229e-19■■■■■ 75
GTF2F1P35269 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 74.7
GTF2F1P35269 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.329e-8■■■■■ 74.7
GTF2F1P35269 ATXN7L3-204ENST00000587022 298 ntTSL 310.82□□□□□ -0.689e-8■■■■■ 74.7
GTF2F1P35269 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 513.32□□□□□ -0.289e-11■■■■■ 74.7
GTF2F1P35269 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 530.64■■■□□ 2.53e-9■■■■■ 74.4
GTF2F1P35269 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.236e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 320.83■□□□□ 0.936e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.856e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.826e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.616e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.246e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-47■■■■■ 74.2
GTF2F1P35269 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 326.57■■□□□ 1.849e-10■■■■■ 74.1
GTF2F1P35269 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 417.22■□□□□ 0.359e-10■■■■■ 74.1
GTF2F1P35269 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 522.42■■□□□ 1.182e-18■■■■■ 74
GTF2F1P35269 SYMPK-211ENST00000598364 995 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-18■■■■■ 74
GTF2F1P35269 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 216.89■□□□□ 0.292e-18■■■■■ 74
GTF2F1P35269 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 516.59■□□□□ 0.252e-18■■■■■ 74
GTF2F1P35269 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-18■■■■■ 74
GTF2F1P35269 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 223.46■■□□□ 1.356e-8■■■■■ 73.9
GTF2F1P35269 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.59□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 73.9
GTF2F1P35269 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 322.36■■□□□ 1.171e-12■■■■■ 73.9
GTF2F1P35269 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 73.3
GTF2F1P35269 IGFL2-AS1-205ENST00000599817 340 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 73.3
GTF2F1P35269 IGFL2-AS1-201ENST00000594027 294 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 73.3
GTF2F1P35269 GABBR1-208ENST00000472823 4286 ntTSL 521.67■■□□□ 1.066e-7■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 C1QTNF12-205ENST00000486627 639 ntTSL 324.72■■□□□ 1.556e-9■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.211e-19■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 515.37■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 72.8
GTF2F1P35269 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 212.17□□□□□ -0.466e-9■■■■■ 72.3
GTF2F1P35269 MGRN1-214ENST00000591673 568 ntTSL 414.42□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 72.2
GTF2F1P35269 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 71.9
GTF2F1P35269 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 71.9
GTF2F1P35269 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 71.9
GTF2F1P35269 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.67e-9■■■■■ 71.8
GTF2F1P35269 TFPT-204ENST00000420715 737 ntTSL 525.03■■□□□ 1.67e-9■■■■■ 71.8
GTF2F1P35269 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.67e-9■■■■■ 71.8
GTF2F1P35269 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.547e-9■■■■■ 71.8
GTF2F1P35269 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.845e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.785e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.745e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 516.49■□□□□ 0.235e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.225e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 515.72■□□□□ 0.115e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 71.5
GTF2F1P35269 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-15■■■■■ 71.4
GTF2F1P35269 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 71.2
GTF2F1P35269 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 511.46□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 71.2
GTF2F1P35269 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.453e-9■■■■■ 71.2
GTF2F1P35269 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.223e-9■■■■■ 71.2
GTF2F1P35269 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 221.13■□□□□ 0.971e-17■■■■■ 70.8
GTF2F1P35269 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.35e-34■■■■■ 70.6
GTF2F1P35269 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 530.42■■■□□ 2.462e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 230.42■■■□□ 2.462e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 229.24■■■□□ 2.272e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 329.24■■■□□ 2.272e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 529.24■■■□□ 2.272e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 228.41■■■□□ 2.142e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 528.09■■■□□ 2.092e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.032e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 527.65■■■□□ 2.022e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 326.42■■□□□ 1.822e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)25.29■■□□□ 1.642e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.512e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 523.68■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.182e-9■■■■■ 69.5
GTF2F1P35269 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 521.08■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 69.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 74.3 ms