Protein–RNA interactions for Protein: P34243

HCS1, DNA polymerase alpha-associated DNA helicase A, yeastyeast

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCS1P34243 SNG1YGR197C 1644 nt10.29□□□□□ -0.76
HCS1P34243 HSL7YBR133C 2484 nt10.29□□□□□ -0.76
HCS1P34243 TRM5YHR070W 1500 nt10.29□□□□□ -0.76
HCS1P34243 DDR2YOL052C-A 186 nt10.28□□□□□ -0.76
HCS1P34243 RAX1YOR301W 1308 nt10.26□□□□□ -0.77
HCS1P34243 PTH1YHR189W 573 nt10.25□□□□□ -0.77
HCS1P34243 RPM1RPM1 483 nt10.25□□□□□ -0.77
HCS1P34243 AAC1YMR056C 930 nt10.22□□□□□ -0.77
HCS1P34243 FUR4YBR021W 1902 nt10.22□□□□□ -0.77
HCS1P34243 CCA1YER168C 1641 nt10.21□□□□□ -0.78
HCS1P34243 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.2□□□□□ -0.78
HCS1P34243 AQY1YPR192W 918 nt10.2□□□□□ -0.78
HCS1P34243 YLR235CYLR235C 399 nt10.19□□□□□ -0.78
HCS1P34243 SPP1YPL138C 1062 nt10.19□□□□□ -0.78
HCS1P34243 BNA2YJR078W 1362 nt10.17□□□□□ -0.78
HCS1P34243 PRP4YPR178W 1398 nt10.17□□□□□ -0.78
HCS1P34243 TIM23YNR017W 669 nt10.17□□□□□ -0.78
HCS1P34243 YLR179CYLR179C 606 nt10.16□□□□□ -0.78
HCS1P34243 ANP1YEL036C 1503 nt10.16□□□□□ -0.78
HCS1P34243 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.15□□□□□ -0.78
HCS1P34243 CMP2YML057W 1815 nt10.14□□□□□ -0.79
HCS1P34243 STB1YNL309W 1263 nt10.13□□□□□ -0.79
HCS1P34243 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.12□□□□□ -0.79
HCS1P34243 YEL076CYEL076C 651 nt10.12□□□□□ -0.79
HCS1P34243 YLR464WYLR464W 651 nt10.12□□□□□ -0.79
HCS1P34243 DPS1YLL018C 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
HCS1P34243 HEL2YDR266C 1920 nt10.11□□□□□ -0.79
HCS1P34243 SPC25YER018C 666 nt10.09□□□□□ -0.79
HCS1P34243 GPI16YHR188C 1833 nt10.09□□□□□ -0.79
HCS1P34243 FEN2YCR028C 1539 nt10.08□□□□□ -0.8
HCS1P34243 MIC12YBR262C 321 nt10.06□□□□□ -0.8
HCS1P34243 YKL030WYKL030W 606 nt10.05□□□□□ -0.8
HCS1P34243 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.05□□□□□ -0.8
HCS1P34243 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.05□□□□□ -0.8
HCS1P34243 BIO5YNR056C 1686 nt10.05□□□□□ -0.8
HCS1P34243 PBP1YGR178C 2169 nt10.05□□□□□ -0.8
HCS1P34243 CYT2YKL087C 675 nt10.04□□□□□ -0.8
HCS1P34243 VPS60YDR486C 690 nt10.03□□□□□ -0.8
HCS1P34243 BMT6YLR063W 1098 nt10.03□□□□□ -0.8
HCS1P34243 DUS1YML080W 1272 nt10.03□□□□□ -0.8
HCS1P34243 WSC2YNL283C 1512 nt10.02□□□□□ -0.81
HCS1P34243 CCT4YDL143W 1587 nt10.01□□□□□ -0.81
HCS1P34243 SWC5YBR231C 912 nt10.01□□□□□ -0.81
HCS1P34243 AHT1YHR093W 549 nt10□□□□□ -0.81
HCS1P34243 HHO1YPL127C 777 nt10□□□□□ -0.81
HCS1P34243 YIR016WYIR016W 798 nt9.99□□□□□ -0.81
HCS1P34243 YPR064WYPR064W 420 nt9.99□□□□□ -0.81
HCS1P34243 AGP1YCL025C 1902 nt9.99□□□□□ -0.81
HCS1P34243 SNF1YDR477W 1902 nt9.96□□□□□ -0.81
HCS1P34243 ALG3YBL082C 1377 nt9.96□□□□□ -0.82
HCS1P34243 YCL074WYCL074W 927 nt9.93□□□□□ -0.82
HCS1P34243 YGR201CYGR201C 678 nt9.93□□□□□ -0.82
HCS1P34243 YKR005CYKR005C 1578 nt9.92□□□□□ -0.82
HCS1P34243 SFP1YLR403W 2052 nt9.91□□□□□ -0.82
HCS1P34243 MRPL8YJL063C 717 nt9.9□□□□□ -0.82
HCS1P34243 TAD3YLR316C 969 nt9.9□□□□□ -0.82
HCS1P34243 YAT1YAR035W 2064 nt9.87□□□□□ -0.83
HCS1P34243 MET2YNL277W 1461 nt9.86□□□□□ -0.83
HCS1P34243 XDJ1YLR090W 1380 nt9.85□□□□□ -0.83
HCS1P34243 YGR259CYGR259C 441 nt9.84□□□□□ -0.83
HCS1P34243 ADO1YJR105W 1023 nt9.84□□□□□ -0.83
HCS1P34243 NPP1YCR026C 2229 nt9.83□□□□□ -0.84
HCS1P34243 IRC24YIR036C 792 nt9.82□□□□□ -0.84
HCS1P34243 RTG1YOL067C 534 nt9.82□□□□□ -0.84
HCS1P34243 AVT6YER119C 1347 nt9.82□□□□□ -0.84
HCS1P34243 GOR1YNL274C 1053 nt9.8□□□□□ -0.84
HCS1P34243 DUT1YBR252W 444 nt9.8□□□□□ -0.84
HCS1P34243 YLR415CYLR415C 339 nt9.79□□□□□ -0.84
HCS1P34243 GDH3YAL062W 1374 nt9.78□□□□□ -0.84
HCS1P34243 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.77□□□□□ -0.84
HCS1P34243 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.77□□□□□ -0.84
HCS1P34243 BDH1YAL060W 1149 nt9.77□□□□□ -0.85
HCS1P34243 AQY2YLL052C 450 nt9.77□□□□□ -0.85
HCS1P34243 STR3YGL184C 1398 nt9.76□□□□□ -0.85
HCS1P34243 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.76□□□□□ -0.85
HCS1P34243 NDI1YML120C 1542 nt9.76□□□□□ -0.85
HCS1P34243 TIM17YJL143W 477 nt9.72□□□□□ -0.85
HCS1P34243 SHM2YLR058C 1410 nt9.72□□□□□ -0.85
HCS1P34243 HUA1YGR268C 597 nt9.71□□□□□ -0.86
HCS1P34243 SSN3YPL042C 1668 nt9.7□□□□□ -0.86
HCS1P34243 RTN2YDL204W 1182 nt9.67□□□□□ -0.86
HCS1P34243 RIM8YGL045W 1629 nt9.67□□□□□ -0.86
HCS1P34243 GID7YCL039W 2238 nt9.66□□□□□ -0.86
HCS1P34243 MAE1YKL029C 2010 nt9.66□□□□□ -0.86
HCS1P34243 YSP3YOR003W 1437 nt9.65□□□□□ -0.87
HCS1P34243 SPT20YOL148C 1815 nt9.62□□□□□ -0.87
HCS1P34243 HMG2YLR450W 3138 nt9.6□□□□□ -0.87
HCS1P34243 DAT1YML113W 747 nt9.6□□□□□ -0.87
HCS1P34243 TPO4YOR273C 1980 nt9.59□□□□□ -0.87
HCS1P34243 NIT1YIL164C 600 nt9.59□□□□□ -0.87
HCS1P34243 SGT2YOR007C 1041 nt9.58□□□□□ -0.88
HCS1P34243 YNL115CYNL115C 1935 nt9.57□□□□□ -0.88
HCS1P34243 YCR102CYCR102C 1107 nt9.54□□□□□ -0.88
HCS1P34243 PEX25YPL112C 1185 nt9.54□□□□□ -0.88
HCS1P34243 UGA4YDL210W 1716 nt9.51□□□□□ -0.89
HCS1P34243 NBP35YGL091C 987 nt9.5□□□□□ -0.89
HCS1P34243 YGL114WYGL114W 2178 nt9.5□□□□□ -0.89
HCS1P34243 PLB1YMR008C 1995 nt9.49□□□□□ -0.89
HCS1P34243 INA1YLR413W 2028 nt9.48□□□□□ -0.89
HCS1P34243 VPS75YNL246W 795 nt9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms