Protein–RNA interactions for Protein: P32610

VMA8, V-type proton ATPase subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMA8P32610 ESBP6YNL125C 2022 nt9.56□□□□□ -0.88
VMA8P32610 SNG1YGR197C 1644 nt9.56□□□□□ -0.88
VMA8P32610 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 ADH2YMR303C 1047 nt9.55□□□□□ -0.88
VMA8P32610 SOR2YDL246C 1074 nt9.54□□□□□ -0.88
VMA8P32610 IRC24YIR036C 792 nt9.54□□□□□ -0.88
VMA8P32610 SOR1YJR159W 1074 nt9.54□□□□□ -0.88
VMA8P32610 FMP45YDL222C 930 nt9.53□□□□□ -0.88
VMA8P32610 SPT20YOL148C 1815 nt9.52□□□□□ -0.89
VMA8P32610 MCM5YLR274W 2328 nt9.52□□□□□ -0.89
VMA8P32610 MAS1YLR163C 1389 nt9.51□□□□□ -0.89
VMA8P32610 ERF2YLR246W 1080 nt9.51□□□□□ -0.89
VMA8P32610 RIM8YGL045W 1629 nt9.51□□□□□ -0.89
VMA8P32610 SFP1YLR403W 2052 nt9.49□□□□□ -0.89
VMA8P32610 ERV46YAL042W 1248 nt9.49□□□□□ -0.89
VMA8P32610 YKR040CYKR040C 504 nt9.49□□□□□ -0.89
VMA8P32610 MAE1YKL029C 2010 nt9.48□□□□□ -0.89
VMA8P32610 MXR2YCL033C 507 nt9.48□□□□□ -0.89
VMA8P32610 YIH1YCR059C 777 nt9.46□□□□□ -0.9
VMA8P32610 RNQ1YCL028W 1218 nt9.44□□□□□ -0.9
VMA8P32610 YGL114WYGL114W 2178 nt9.44□□□□□ -0.9
VMA8P32610 HEM14YER014W 1620 nt9.43□□□□□ -0.9
VMA8P32610 YPR011CYPR011C 981 nt9.43□□□□□ -0.9
VMA8P32610 CCA1YER168C 1641 nt9.42□□□□□ -0.9
VMA8P32610 CRR1YLR213C 1269 nt9.42□□□□□ -0.9
VMA8P32610 YGR259CYGR259C 441 nt9.41□□□□□ -0.9
VMA8P32610 YLL053CYLL053C 459 nt9.4□□□□□ -0.9
VMA8P32610 LPX1YOR084W 1164 nt9.4□□□□□ -0.9
VMA8P32610 NPP1YCR026C 2229 nt9.4□□□□□ -0.91
VMA8P32610 FRD1YEL047C 1413 nt9.39□□□□□ -0.91
VMA8P32610 YFL067WYFL067W 528 nt9.39□□□□□ -0.91
VMA8P32610 WSC2YNL283C 1512 nt9.38□□□□□ -0.91
VMA8P32610 DTR1YBR180W 1719 nt9.37□□□□□ -0.91
VMA8P32610 HEM12YDR047W 1089 nt9.37□□□□□ -0.91
VMA8P32610 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.35□□□□□ -0.91
VMA8P32610 GPI16YHR188C 1833 nt9.33□□□□□ -0.92
VMA8P32610 RAX1YOR301W 1308 nt9.32□□□□□ -0.92
VMA8P32610 FTR1YER145C 1215 nt9.32□□□□□ -0.92
VMA8P32610 DDR2YOL052C-A 186 nt9.31□□□□□ -0.92
VMA8P32610 INA1YLR413W 2028 nt9.31□□□□□ -0.92
VMA8P32610 ATF2YGR177C 1608 nt9.31□□□□□ -0.92
VMA8P32610 DIC1YLR348C 897 nt9.3□□□□□ -0.92
VMA8P32610 ILV2YMR108W 2064 nt9.29□□□□□ -0.92
VMA8P32610 RSC4YKR008W 1878 nt9.28□□□□□ -0.92
VMA8P32610 AQY1YPR192W 918 nt9.28□□□□□ -0.92
VMA8P32610 TPO4YOR273C 1980 nt9.28□□□□□ -0.92
VMA8P32610 RPC82YPR190C 1965 nt9.27□□□□□ -0.93
VMA8P32610 GAL1YBR020W 1587 nt9.27□□□□□ -0.93
VMA8P32610 ACO2YJL200C 2370 nt9.27□□□□□ -0.93
VMA8P32610 TRM5YHR070W 1500 nt9.26□□□□□ -0.93
VMA8P32610 UGA4YDL210W 1716 nt9.26□□□□□ -0.93
VMA8P32610 RFC1YOR217W 2586 nt9.26□□□□□ -0.93
VMA8P32610 HMG2YLR450W 3138 nt9.26□□□□□ -0.93
VMA8P32610 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.25□□□□□ -0.93
VMA8P32610 MIC10YCL057C-A 294 nt9.25□□□□□ -0.93
VMA8P32610 BNA2YJR078W 1362 nt9.23□□□□□ -0.93
VMA8P32610 YCL074WYCL074W 927 nt9.22□□□□□ -0.93
VMA8P32610 YLR235CYLR235C 399 nt9.22□□□□□ -0.93
VMA8P32610 MUP1YGR055W 1725 nt9.22□□□□□ -0.93
VMA8P32610 YDR306CYDR306C 1437 nt9.2□□□□□ -0.94
VMA8P32610 ANP1YEL036C 1503 nt9.18□□□□□ -0.94
VMA8P32610 TIM23YNR017W 669 nt9.16□□□□□ -0.94
VMA8P32610 SPC25YER018C 666 nt9.15□□□□□ -0.94
VMA8P32610 STB1YNL309W 1263 nt9.15□□□□□ -0.94
VMA8P32610 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.14□□□□□ -0.95
VMA8P32610 YLR179CYLR179C 606 nt9.13□□□□□ -0.95
VMA8P32610 Q0010Q0010 387 nt9.13□□□□□ -0.95
VMA8P32610 PTH1YHR189W 573 nt9.12□□□□□ -0.95
VMA8P32610 DUS1YML080W 1272 nt9.12□□□□□ -0.95
VMA8P32610 FEN2YCR028C 1539 nt9.11□□□□□ -0.95
VMA8P32610 MIC12YBR262C 321 nt9.11□□□□□ -0.95
VMA8P32610 URA8YJR103W 1737 nt9.08□□□□□ -0.96
VMA8P32610 HHO1YPL127C 777 nt9.07□□□□□ -0.96
VMA8P32610 YKL030WYKL030W 606 nt9.06□□□□□ -0.96
VMA8P32610 CCT4YDL143W 1587 nt9.04□□□□□ -0.96
VMA8P32610 PUS7YOR243C 2031 nt9.04□□□□□ -0.96
VMA8P32610 AHT1YHR093W 549 nt9.04□□□□□ -0.96
VMA8P32610 YPR064WYPR064W 420 nt9.04□□□□□ -0.96
VMA8P32610 YIR016WYIR016W 798 nt9.03□□□□□ -0.96
VMA8P32610 HOL1YNR055C 1761 nt9.03□□□□□ -0.96
VMA8P32610 YGR201CYGR201C 678 nt9.02□□□□□ -0.97
VMA8P32610 SPP1YPL138C 1062 nt9.02□□□□□ -0.97
VMA8P32610 SWC5YBR231C 912 nt9.02□□□□□ -0.97
VMA8P32610 VPS60YDR486C 690 nt9.01□□□□□ -0.97
VMA8P32610 GNP1YDR508C 1992 nt9.01□□□□□ -0.97
VMA8P32610 YHL008CYHL008C 1884 nt8.99□□□□□ -0.97
VMA8P32610 GAL2YLR081W 1725 nt8.99□□□□□ -0.97
VMA8P32610 YMR209CYMR209C 1374 nt8.98□□□□□ -0.97
VMA8P32610 GTB1YDR221W 2109 nt8.97□□□□□ -0.97
VMA8P32610 AGP1YCL025C 1902 nt8.95□□□□□ -0.98
VMA8P32610 TAD3YLR316C 969 nt8.94□□□□□ -0.98
VMA8P32610 HXK1YFR053C 1458 nt8.94□□□□□ -0.98
VMA8P32610 ALG3YBL082C 1377 nt8.92□□□□□ -0.98
VMA8P32610 THI72YOR192C 1800 nt8.91□□□□□ -0.98
VMA8P32610 GDH3YAL062W 1374 nt8.89□□□□□ -0.99
VMA8P32610 GOR1YNL274C 1053 nt8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms