Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 SIM1YIL123W 1431 nt11.06□□□□□ -0.64
BRF1P29056 BIO4YNR057C 714 nt11.05□□□□□ -0.64
BRF1P29056 YLL053CYLL053C 459 nt11.04□□□□□ -0.64
BRF1P29056 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.01□□□□□ -0.65
BRF1P29056 YPR064WYPR064W 420 nt11.01□□□□□ -0.65
BRF1P29056 SPT8YLR055C 1809 nt11□□□□□ -0.65
BRF1P29056 WSC2YNL283C 1512 nt10.98□□□□□ -0.65
BRF1P29056 FTR1YER145C 1215 nt10.97□□□□□ -0.65
BRF1P29056 AHT1YHR093W 549 nt10.97□□□□□ -0.65
BRF1P29056 TAD3YLR316C 969 nt10.96□□□□□ -0.65
BRF1P29056 GAL1YBR020W 1587 nt10.94□□□□□ -0.66
BRF1P29056 AQY1YPR192W 918 nt10.93□□□□□ -0.66
BRF1P29056 TRM5YHR070W 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
BRF1P29056 YFR018CYFR018C 1092 nt10.88□□□□□ -0.67
BRF1P29056 ERF2YLR246W 1080 nt10.86□□□□□ -0.67
BRF1P29056 ATF2YGR177C 1608 nt10.85□□□□□ -0.67
BRF1P29056 HSP60YLR259C 1719 nt10.85□□□□□ -0.67
BRF1P29056 YFL067WYFL067W 528 nt10.83□□□□□ -0.68
BRF1P29056 STB1YNL309W 1263 nt10.83□□□□□ -0.68
BRF1P29056 DDR2YOL052C-A 186 nt10.83□□□□□ -0.68
BRF1P29056 SPC25YER018C 666 nt10.82□□□□□ -0.68
BRF1P29056 RRT5YFR032C 870 nt10.81□□□□□ -0.68
BRF1P29056 PAU16YKL224C 372 nt10.81□□□□□ -0.68
BRF1P29056 CRR1YLR213C 1269 nt10.81□□□□□ -0.68
BRF1P29056 PRE6YOL038W 765 nt10.81□□□□□ -0.68
BRF1P29056 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.8□□□□□ -0.68
BRF1P29056 CCT4YDL143W 1587 nt10.79□□□□□ -0.68
BRF1P29056 SWE1YJL187C 2460 nt10.79□□□□□ -0.68
BRF1P29056 BDH1YAL060W 1149 nt10.78□□□□□ -0.68
BRF1P29056 GPI16YHR188C 1833 nt10.77□□□□□ -0.68
BRF1P29056 LYS4YDR234W 2082 nt10.77□□□□□ -0.69
BRF1P29056 NAR1YNL240C 1476 nt10.77□□□□□ -0.69
BRF1P29056 HSL7YBR133C 2484 nt10.76□□□□□ -0.69
BRF1P29056 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.76□□□□□ -0.69
BRF1P29056 SBA1YKL117W 651 nt10.76□□□□□ -0.69
BRF1P29056 SSN3YPL042C 1668 nt10.76□□□□□ -0.69
BRF1P29056 YFL066CYFL066C 1179 nt10.75□□□□□ -0.69
BRF1P29056 YLR415CYLR415C 339 nt10.74□□□□□ -0.69
BRF1P29056 PEX25YPL112C 1185 nt10.74□□□□□ -0.69
BRF1P29056 YSP3YOR003W 1437 nt10.74□□□□□ -0.69
BRF1P29056 VPS60YDR486C 690 nt10.73□□□□□ -0.69
BRF1P29056 SWC5YBR231C 912 nt10.72□□□□□ -0.69
BRF1P29056 HEM12YDR047W 1089 nt10.71□□□□□ -0.69
BRF1P29056 ANP1YEL036C 1503 nt10.71□□□□□ -0.69
BRF1P29056 SNG1YGR197C 1644 nt10.71□□□□□ -0.69
BRF1P29056 FEN2YCR028C 1539 nt10.7□□□□□ -0.7
BRF1P29056 YNL115CYNL115C 1935 nt10.69□□□□□ -0.7
BRF1P29056 MIC10YCL057C-A 294 nt10.69□□□□□ -0.7
BRF1P29056 ALG3YBL082C 1377 nt10.67□□□□□ -0.7
BRF1P29056 CMP2YML057W 1815 nt10.63□□□□□ -0.71
BRF1P29056 GLK1YCL040W 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
BRF1P29056 YIR016WYIR016W 798 nt10.6□□□□□ -0.71
BRF1P29056 HEL2YDR266C 1920 nt10.6□□□□□ -0.71
BRF1P29056 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
BRF1P29056 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
BRF1P29056 BSP1YPR171W 1731 nt10.59□□□□□ -0.71
BRF1P29056 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.56□□□□□ -0.72
BRF1P29056 VPS75YNL246W 795 nt10.55□□□□□ -0.72
BRF1P29056 NAT4YMR069W 858 nt10.53□□□□□ -0.72
BRF1P29056 FUR4YBR021W 1902 nt10.5□□□□□ -0.73
BRF1P29056 BNA2YJR078W 1362 nt10.5□□□□□ -0.73
BRF1P29056 TIM17YJL143W 477 nt10.48□□□□□ -0.73
BRF1P29056 MIR1YJR077C 936 nt10.48□□□□□ -0.73
BRF1P29056 RAX1YOR301W 1308 nt10.48□□□□□ -0.73
BRF1P29056 MIC12YBR262C 321 nt10.46□□□□□ -0.73
BRF1P29056 SHM2YLR058C 1410 nt10.44□□□□□ -0.74
BRF1P29056 XDJ1YLR090W 1380 nt10.44□□□□□ -0.74
BRF1P29056 THI74YDR438W 1113 nt10.44□□□□□ -0.74
BRF1P29056 MET2YNL277W 1461 nt10.43□□□□□ -0.74
BRF1P29056 MSF1YPR047W 1410 nt10.43□□□□□ -0.74
BRF1P29056 CCA1YER168C 1641 nt10.43□□□□□ -0.74
BRF1P29056 YAT1YAR035W 2064 nt10.43□□□□□ -0.74
BRF1P29056 PAU7YAR020C 168 nt10.41□□□□□ -0.74
BRF1P29056 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
BRF1P29056 SFP1YLR403W 2052 nt10.39□□□□□ -0.75
BRF1P29056 HHO1YPL127C 777 nt10.38□□□□□ -0.75
BRF1P29056 PBP1YGR178C 2169 nt10.38□□□□□ -0.75
BRF1P29056 CYT2YKL087C 675 nt10.37□□□□□ -0.75
BRF1P29056 AAC1YMR056C 930 nt10.37□□□□□ -0.75
BRF1P29056 GDH3YAL062W 1374 nt10.37□□□□□ -0.75
BRF1P29056 YGR201CYGR201C 678 nt10.35□□□□□ -0.75
BRF1P29056 GID7YCL039W 2238 nt10.35□□□□□ -0.75
BRF1P29056 NIT1YIL164C 600 nt10.34□□□□□ -0.75
BRF1P29056 DAT1YML113W 747 nt10.34□□□□□ -0.75
BRF1P29056 SGT2YOR007C 1041 nt10.33□□□□□ -0.76
BRF1P29056 DPS1YLL018C 1674 nt10.33□□□□□ -0.76
BRF1P29056 NPP1YCR026C 2229 nt10.33□□□□□ -0.76
BRF1P29056 BMT6YLR063W 1098 nt10.32□□□□□ -0.76
BRF1P29056 SHB17YKR043C 816 nt10.31□□□□□ -0.76
BRF1P29056 UBA4YHR111W 1323 nt10.31□□□□□ -0.76
BRF1P29056 AVT6YER119C 1347 nt10.28□□□□□ -0.76
BRF1P29056 YDR010CYDR010C 333 nt10.26□□□□□ -0.77
BRF1P29056 YGL034CYGL034C 366 nt10.25□□□□□ -0.77
BRF1P29056 YMR244WYMR244W 1068 nt10.25□□□□□ -0.77
BRF1P29056 YKR005CYKR005C 1578 nt10.25□□□□□ -0.77
BRF1P29056 BIO5YNR056C 1686 nt10.25□□□□□ -0.77
BRF1P29056 YSR3YKR053C 1215 nt10.24□□□□□ -0.77
BRF1P29056 AGP1YCL025C 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
BRF1P29056 GOR1YNL274C 1053 nt10.22□□□□□ -0.77
BRF1P29056 GLR1YPL091W 1452 nt10.19□□□□□ -0.78
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