Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHN1P15882 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHN1P15882 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHN1P15882 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHN1P15882 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHN1P15882 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHN1P15882 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHN1P15882 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHN1P15882 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHN1P15882 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHN1P15882 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHN1P15882 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHN1P15882 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHN1P15882 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHN1P15882 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CHN1P15882 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHN1P15882 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHN1P15882 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHN1P15882 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHN1P15882 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHN1P15882 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHN1P15882 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHN1P15882 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHN1P15882 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHN1P15882 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHN1P15882 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHN1P15882 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHN1P15882 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHN1P15882 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHN1P15882 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHN1P15882 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHN1P15882 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHN1P15882 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHN1P15882 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHN1P15882 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHN1P15882 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHN1P15882 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHN1P15882 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHN1P15882 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHN1P15882 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHN1P15882 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHN1P15882 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHN1P15882 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHN1P15882 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHN1P15882 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHN1P15882 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHN1P15882 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHN1P15882 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHN1P15882 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHN1P15882 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHN1P15882 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHN1P15882 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHN1P15882 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHN1P15882 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHN1P15882 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHN1P15882 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHN1P15882 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHN1P15882 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHN1P15882 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHN1P15882 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHN1P15882 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHN1P15882 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHN1P15882 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHN1P15882 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHN1P15882 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHN1P15882 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHN1P15882 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHN1P15882 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHN1P15882 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHN1P15882 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHN1P15882 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHN1P15882 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHN1P15882 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHN1P15882 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHN1P15882 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHN1P15882 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHN1P15882 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHN1P15882 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHN1P15882 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHN1P15882 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHN1P15882 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHN1P15882 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHN1P15882 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHN1P15882 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHN1P15882 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHN1P15882 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHN1P15882 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHN1P15882 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHN1P15882 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHN1P15882 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHN1P15882 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHN1P15882 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHN1P15882 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHN1P15882 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHN1P15882 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHN1P15882 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHN1P15882 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHN1P15882 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHN1P15882 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHN1P15882 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms