Protein–RNA interactions for Protein: O35143

Atpif1, ATPase inhibitor, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpif1O35143 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atpif1O35143 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atpif1O35143 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atpif1O35143 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atpif1O35143 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpif1O35143 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atpif1O35143 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atpif1O35143 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atpif1O35143 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atpif1O35143 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atpif1O35143 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atpif1O35143 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atpif1O35143 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atpif1O35143 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atpif1O35143 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atpif1O35143 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atpif1O35143 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atpif1O35143 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atpif1O35143 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atpif1O35143 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atpif1O35143 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atpif1O35143 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atpif1O35143 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atpif1O35143 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atpif1O35143 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atpif1O35143 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atpif1O35143 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atpif1O35143 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atpif1O35143 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atpif1O35143 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atpif1O35143 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms