RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000091579.5

Gkap1-201, Transcript of G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gkap1, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa56,48■■■■■ 6,63
Gkap1-201ENSMUST00000091579 NischQ80TM9 1593 aa55,99■■■■■ 6,55
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Abcc9P70170 1546 aa54,31■■■■■ 6,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Abcc8B2RUS7 1588 aa53,92■■■■■ 6,22
Gkap1-201ENSMUST00000091579 ScribQ80U72 1612 aa51,49■■■■■ 5,83
Gkap1-201ENSMUST00000091579 NacadQ5SWP3 1504 aa50,02■■■■■ 5,6
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Dcaf1Q80TR8 1506 aa49,99■■■■■ 5,59
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Kdm5dQ62240 1548 aa49,98■■■■■ 5,59
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rhox8Q6VSS7 320 aa49■■■■■ 5,43
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48,99■■■■■ 5,43
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa48,87■■■■■ 5,41
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ccdc180J3QNE4 1664 aa48,51■■■■■ 5,36
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Baz1aO88379 1555 aa48,28■■■■■ 5,32
Gkap1-201ENSMUST00000091579 BicraF8VPZ9 1578 aa48,14■■■■■ 5,3
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Crybg2B7ZCC2 1516 aa48,06■■■■■ 5,28
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP47,32■■■■■ 5,16
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Smarca2Q6DIC0 1577 aa46,96■■■■■ 5,11
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rtl1Q7M732 1744 aa46,93■■■■■ 5,1
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46,68■■■■■ 5,06
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46,4■■■■■ 5,02
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa46,35■■■■■ 5,01
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP46,33■■■■■ 5,01
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP45,98■■■■■ 4,95
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45,95■■■■■ 4,95
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa45,7■■■■■ 4,91
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45,69■■■■■ 4,9
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP45,68■■■■■ 4,9
Gkap1-201ENSMUST00000091579 CftrP26361 1476 aa45,54■■■■■ 4,88
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa45,5■■■■■ 4,87
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Synj1Q8CHC4 1574 aa45,49■■■■■ 4,87
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45,44■■■■■ 4,87
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa45,44■■■■■ 4,86
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45,35■■■■■ 4,85
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45,22■■■■■ 4,83
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Trim41Q5NCC3 630 aa45,21■■■■■ 4,83
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Fam135aQ6NS59 1506 aa45,12■■■■■ 4,81
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44,94■■■■■ 4,78
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44,77■■■■■ 4,76
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Baz1bQ9Z277 1479 aa44,77■■■■■ 4,76
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP44,65■■■■■ 4,74
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44,39■■■■■ 4,7
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Golga3P55937 1487 aa44,33■■■■■ 4,69
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Top2bQ64511 1612 aa44,22■■■■■ 4,67
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP44,17■■■■■ 4,66
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Lamc3Q9R0B6 1581 aa44,05■■■■■ 4,64
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Mrc2Q64449 1479 aa44,03■■■■■ 4,64
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cngb1E1AZ71 1325 aa43,97■■■■■ 4,63
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Kif15Q6P9L6 1387 aa43,97■■■■■ 4,63
Gkap1-201ENSMUST00000091579 TnnQ80Z71 1560 aa43,82■■■■■ 4,6
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cux2P70298 1426 aa43,77■■■■■ 4,6
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Fmn1Q05860 1466 aa43,69■■■■■ 4,59
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ccdc18Q640L5 1455 aa43,38■■■■■ 4,54
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP43,34■■■■■ 4,53
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Camsap1A2AHC3 1581 aa43,32■■■■■ 4,53
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cep164Q5DU05 1446 aa43,32■■■■■ 4,53
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa43,27■■■■■ 4,52
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43,25■■■■■ 4,51
Gkap1-201ENSMUST00000091579 HrcG5E8J6 738 aa43,15■■■■■ 4,5
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Il27Q8K3I6 234 aa43,04■■■■■ 4,48
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP43,02■■■■■ 4,48
Gkap1-201ENSMUST00000091579 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP43,01■■■■■ 4,48
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Chic1Q8CBW7 227 aa43■■■■■ 4,47
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa42,99■■■■■ 4,47
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42,91■■■■■ 4,46
Gkap1-201ENSMUST00000091579 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42,83■■■■■ 4,45
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Grin2bQ01097 1482 aa42,81■■■■■ 4,44
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Crocc2F6XLV1 1638 aa42,75■■■■■ 4,43
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Duox2A2AQ99 1517 aa42,63■■■■■ 4,42
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42,62■■■■■ 4,41
Gkap1-201ENSMUST00000091579 NrkQ9R0G8 1455 aa42,6■■■■■ 4,41
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Plb1Q3TTY0 1478 aa42,59■■■■■ 4,41
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Efcab5A0JP43 1406 aa42,53■■■■■ 4,4
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42,43■■■■■ 4,38
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Shroom4Q1W617 1475 aa42,4■■■■■ 4,38
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Ift140E9PY46 1464 aa42,36■■■■■ 4,37
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Samd9lQ69Z37 1561 aa42,3■■■■■ 4,36
Gkap1-201ENSMUST00000091579 PtprkP35822 1457 aa42,29■■■■■ 4,36
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Disp1Q3TDN0 1521 aa42,13■■■■■ 4,33
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP42,08■■■■■ 4,33
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa42,03■■■■■ 4,32
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Gab3Q8BSM5 595 aa42,01■■■■■ 4,32
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rusc2Q80U22 1514 aa42■■■■■ 4,31
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41,97■■■■■ 4,31
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41,95■■■■■ 4,31
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Npm2Q80W85 207 aa41,95■■■■■ 4,31
Gkap1-201ENSMUST00000091579 SynmQ70IV5 1561 aa41,94■■■■■ 4,3
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41,91■■■■■ 4,3
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41,88■■■■■ 4,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa41,87■■■■■ 4,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41,86■■■■■ 4,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Grin2aP35436 1464 aa41,85■■■■■ 4,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Gpatch8A2A6A1 1505 aa41,82■■■■■ 4,29
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Map3k1P53349 1493 aa41,76■■■■■ 4,28
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP41,75■■■■■ 4,27
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Zeb1Q64318 1117 aa41,74■■■■■ 4,27
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Pla2r1Q62028 1487 aa41,72■■■■■ 4,27
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Arhgap35Q91YM2 1499 aa41,72■■■■■ 4,27
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Cep162Q6ZQ06 1403 aa41,72■■■■■ 4,27
Gkap1-201ENSMUST00000091579 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41,61■■■■■ 4,25
Gkap1-201ENSMUST00000091579 Carmil1Q6EDY6 1374 aa41,54■■■■■ 4,24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14,1 ms