Protein–RNA interactions for Protein: O35143

Atpif1, ATPase inhibitor, mitochondrial, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpif1O35143 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Atpif1O35143 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atpif1O35143 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atpif1O35143 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atpif1O35143 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atpif1O35143 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atpif1O35143 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Atpif1O35143 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atpif1O35143 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atpif1O35143 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atpif1O35143 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atpif1O35143 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atpif1O35143 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Atpif1O35143 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atpif1O35143 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atpif1O35143 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atpif1O35143 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atpif1O35143 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atpif1O35143 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atpif1O35143 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atpif1O35143 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atpif1O35143 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atpif1O35143 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atpif1O35143 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atpif1O35143 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atpif1O35143 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atpif1O35143 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atpif1O35143 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atpif1O35143 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atpif1O35143 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atpif1O35143 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atpif1O35143 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atpif1O35143 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atpif1O35143 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atpif1O35143 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atpif1O35143 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atpif1O35143 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atpif1O35143 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atpif1O35143 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atpif1O35143 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atpif1O35143 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atpif1O35143 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atpif1O35143 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atpif1O35143 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atpif1O35143 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atpif1O35143 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atpif1O35143 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atpif1O35143 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atpif1O35143 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atpif1O35143 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atpif1O35143 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atpif1O35143 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atpif1O35143 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atpif1O35143 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atpif1O35143 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atpif1O35143 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atpif1O35143 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atpif1O35143 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atpif1O35143 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atpif1O35143 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atpif1O35143 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atpif1O35143 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atpif1O35143 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atpif1O35143 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atpif1O35143 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atpif1O35143 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atpif1O35143 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atpif1O35143 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atpif1O35143 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atpif1O35143 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atpif1O35143 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atpif1O35143 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atpif1O35143 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atpif1O35143 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atpif1O35143 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atpif1O35143 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atpif1O35143 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atpif1O35143 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atpif1O35143 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atpif1O35143 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atpif1O35143 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atpif1O35143 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atpif1O35143 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atpif1O35143 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atpif1O35143 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atpif1O35143 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atpif1O35143 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atpif1O35143 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atpif1O35143 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atpif1O35143 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atpif1O35143 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atpif1O35143 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atpif1O35143 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atpif1O35143 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atpif1O35143 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atpif1O35143 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atpif1O35143 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atpif1O35143 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atpif1O35143 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atpif1O35143 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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