RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111018.1

Srp9-202, Transcript of Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Srp9, Length 823 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa60.6■■■■■ 7.29
Srp9-202ENSMUST00000111018 NischQ80TM9 1593 aa59.61■■■■■ 7.13
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc8B2RUS7 1588 aa57.82■■■■■ 6.85
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc9P70170 1546 aa57.61■■■■■ 6.81
Srp9-202ENSMUST00000111018 ScribQ80U72 1612 aa55.97■■■■■ 6.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 NacadQ5SWP3 1504 aa54.22■■■■■ 6.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kdm5dQ62240 1548 aa54.02■■■■■ 6.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Sycp2Q9CUU3 1500 aa53.18■■■■■ 6.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dcaf1Q80TR8 1506 aa53.08■■■■■ 6.09
Srp9-202ENSMUST00000111018 BicraF8VPZ9 1578 aa52.51■■■■■ 6
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa51.87■■■■■ 5.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51.85■■■■■ 5.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Crybg2B7ZCC2 1516 aa51.18■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Baz1aO88379 1555 aa51.13■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc180J3QNE4 1664 aa51.04■■■■■ 5.76
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rhox8Q6VSS7 320 aa50.97■■■■■ 5.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
Srp9-202ENSMUST00000111018 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
Srp9-202ENSMUST00000111018 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.66
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa50.01■■■■■ 5.6
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ercc6F8VPZ5 1481 aa49.98■■■■■ 5.59
Srp9-202ENSMUST00000111018 Smarca2Q6DIC0 1577 aa49.94■■■■■ 5.59
Srp9-202ENSMUST00000111018 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
Srp9-202ENSMUST00000111018 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa49.7■■■■■ 5.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa49.69■■■■■ 5.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fam135aQ6NS59 1506 aa49.63■■■■■ 5.54
Srp9-202ENSMUST00000111018 Wdr62Q3U3T8 1523 aa49.39■■■■■ 5.5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Frmpd1A2AKB4 1549 aa49.37■■■■■ 5.49
Srp9-202ENSMUST00000111018 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
Srp9-202ENSMUST00000111018 Baz1bQ9Z277 1479 aa49.15■■■■■ 5.46
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ubl4bQ9CQ84 188 aa48.84■■■■■ 5.41
Srp9-202ENSMUST00000111018 Unc13aQ4KUS2 1712 aa48.52■■■■■ 5.36
Srp9-202ENSMUST00000111018 CftrP26361 1476 aa48.48■■■■■ 5.35
Srp9-202ENSMUST00000111018 Mrc2Q64449 1479 aa48.48■■■■■ 5.35
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa48.33■■■■■ 5.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 Synj1Q8CHC4 1574 aa48.25■■■■■ 5.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rtl1Q7M732 1744 aa48.18■■■■■ 5.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa47.87■■■■■ 5.25
Srp9-202ENSMUST00000111018 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cux2P70298 1426 aa47.51■■■■■ 5.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dnajc5P60904 198 aa47.46■■■■■ 5.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif15Q6P9L6 1387 aa47.42■■■■■ 5.18
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa47.38■■■■■ 5.17
Srp9-202ENSMUST00000111018 Trim41Q5NCC3 630 aa47.31■■■■■ 5.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lamc3Q9R0B6 1581 aa47.15■■■■■ 5.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif21aQ9QXL2 1672 aa47.13■■■■■ 5.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cep164Q5DU05 1446 aa46.79■■■■■ 5.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
Srp9-202ENSMUST00000111018 Shroom2A2ALU4 1481 aa46.52■■■■■ 5.04
Srp9-202ENSMUST00000111018 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc18Q640L5 1455 aa46.44■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 TnnQ80Z71 1560 aa46.44■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Plb1Q3TTY0 1478 aa46.42■■■■■ 5.02
Srp9-202ENSMUST00000111018 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
Srp9-202ENSMUST00000111018 Il27Q8K3I6 234 aa46.35■■■■■ 5.01
Srp9-202ENSMUST00000111018 Golga3P55937 1487 aa46.31■■■■■ 5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Top2bQ64511 1612 aa46.29■■■■■ 5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Camsap1A2AHC3 1581 aa46.2■■■■■ 4.99
Srp9-202ENSMUST00000111018 Crocc2F6XLV1 1638 aa46.16■■■■■ 4.98
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cngb1E1AZ71 1325 aa46.05■■■■■ 4.96
Srp9-202ENSMUST00000111018 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ift140E9PY46 1464 aa45.99■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Col17a1Q07563 1470 aa45.98■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fmn1Q05860 1466 aa45.89■■■■■ 4.94
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rusc2Q80U22 1514 aa45.85■■■■■ 4.93
Srp9-202ENSMUST00000111018 Duox2A2AQ99 1517 aa45.78■■■■■ 4.92
Srp9-202ENSMUST00000111018 Disp1Q3TDN0 1521 aa45.62■■■■■ 4.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Grin2bQ01097 1482 aa45.58■■■■■ 4.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
Srp9-202ENSMUST00000111018 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Efcab5A0JP43 1406 aa45.41■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa45.39■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Samd9lQ69Z37 1561 aa45.33■■■■■ 4.85
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
Srp9-202ENSMUST00000111018 Setd1bQ8CFT2 1985 aa45.25■■■■■ 4.84
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rad54l2Q99NG0 1466 aa45.09■■■■■ 4.81
Srp9-202ENSMUST00000111018 Grin2aP35436 1464 aa45.02■■■■■ 4.8
Srp9-202ENSMUST00000111018 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Magi3Q9EQJ9 1476 aa44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 NrkQ9R0G8 1455 aa44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fgd6Q69ZL1 1399 aa44.98■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44.94■■■■■ 4.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 Adgrl3Q80TS3 1537 aa44.83■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 PtprkP35822 1457 aa44.82■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa44.72■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm156Q58A37 223 aa44.72■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Shroom4Q1W617 1475 aa44.7■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cep170Q6A065 1588 aa44.69■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gpatch8A2A6A1 1505 aa44.69■■■■■ 4.74
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pla2r1Q62028 1487 aa44.66■■■■■ 4.74
Srp9-202ENSMUST00000111018 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa44.63■■■■■ 4.73
Srp9-202ENSMUST00000111018 Chic1Q8CBW7 227 aa44.61■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms