RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207161.1

Gm5601-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm5601, Length 1,437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa58,95■■■■■ 7,03
Gm5601-202ENSMUST00000207161 NischQ80TM9 1593 aa58,09■■■■■ 6,89
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Abcc9P70170 1546 aa56,28■■■■■ 6,6
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Abcc8B2RUS7 1588 aa56,19■■■■■ 6,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 ScribQ80U72 1612 aa54,19■■■■■ 6,27
Gm5601-202ENSMUST00000207161 NacadQ5SWP3 1504 aa52,4■■■■■ 5,98
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Kdm5dQ62240 1548 aa52,36■■■■■ 5,97
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51,74■■■■■ 5,87
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Sycp2Q9CUU3 1500 aa51,41■■■■■ 5,82
Gm5601-202ENSMUST00000207161 BicraF8VPZ9 1578 aa50,73■■■■■ 5,71
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50,64■■■■■ 5,7
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rhox8Q6VSS7 320 aa50,03■■■■■ 5,6
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ccdc180J3QNE4 1664 aa50■■■■■ 5,6
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Baz1aO88379 1555 aa49,94■■■■■ 5,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Crybg2B7ZCC2 1516 aa49,78■■■■■ 5,56
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP49,18■■■■■ 5,46
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa49,13■■■■■ 5,46
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP49,1■■■■■ 5,45
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP48,84■■■■■ 5,41
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP48,76■■■■■ 5,4
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Smarca2Q6DIC0 1577 aa48,52■■■■■ 5,36
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48,4■■■■■ 5,34
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa48,31■■■■■ 5,32
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa48,14■■■■■ 5,3
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ercc6F8VPZ5 1481 aa48,11■■■■■ 5,29
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48■■■■■ 5,28
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rtl1Q7M732 1744 aa47,76■■■■■ 5,24
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Wdr62Q3U3T8 1523 aa47,73■■■■■ 5,23
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Fam135aQ6NS59 1506 aa47,73■■■■■ 5,23
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Frmpd1A2AKB4 1549 aa47,66■■■■■ 5,22
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP47,32■■■■■ 5,17
Gm5601-202ENSMUST00000207161 CftrP26361 1476 aa47,23■■■■■ 5,15
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Baz1bQ9Z277 1479 aa47,17■■■■■ 5,14
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa47,17■■■■■ 5,14
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Synj1Q8CHC4 1574 aa47,14■■■■■ 5,14
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Unc13aQ4KUS2 1712 aa47,07■■■■■ 5,13
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP47,06■■■■■ 5,12
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa46,87■■■■■ 5,09
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ubl4bQ9CQ84 188 aa46,8■■■■■ 5,08
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Mrc2Q64449 1479 aa46,55■■■■■ 5,04
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP46,18■■■■■ 4,98
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Trim41Q5NCC3 630 aa46,18■■■■■ 4,98
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP45,99■■■■■ 4,95
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Kif15Q6P9L6 1387 aa45,89■■■■■ 4,94
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cux2P70298 1426 aa45,87■■■■■ 4,93
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45,85■■■■■ 4,93
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa45,56■■■■■ 4,88
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45,56■■■■■ 4,88
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Top2bQ64511 1612 aa45,49■■■■■ 4,87
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Golga3P55937 1487 aa45,45■■■■■ 4,87
Gm5601-202ENSMUST00000207161 TnnQ80Z71 1560 aa45,4■■■■■ 4,86
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP45,29■■■■■ 4,84
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cep164Q5DU05 1446 aa45,22■■■■■ 4,83
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cngb1E1AZ71 1325 aa45,1■■■■■ 4,81
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ccdc18Q640L5 1455 aa45,06■■■■■ 4,8
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Camsap1A2AHC3 1581 aa45,02■■■■■ 4,8
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Fmn1Q05860 1466 aa44,94■■■■■ 4,78
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP44,92■■■■■ 4,78
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP44,92■■■■■ 4,78
Gm5601-202ENSMUST00000207161 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP44,86■■■■■ 4,77
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP44,85■■■■■ 4,77
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Il27Q8K3I6 234 aa44,85■■■■■ 4,77
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Plb1Q3TTY0 1478 aa44,77■■■■■ 4,76
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Crocc2F6XLV1 1638 aa44,73■■■■■ 4,75
Gm5601-202ENSMUST00000207161 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP44,63■■■■■ 4,74
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Duox2A2AQ99 1517 aa44,42■■■■■ 4,7
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Grin2bQ01097 1482 aa44,4■■■■■ 4,7
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ift140E9PY46 1464 aa44,38■■■■■ 4,69
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dnajc5P60904 198 aa44,33■■■■■ 4,69
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Shroom2A2ALU4 1481 aa44,32■■■■■ 4,68
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44,28■■■■■ 4,68
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rusc2Q80U22 1514 aa44,24■■■■■ 4,67
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44,12■■■■■ 4,65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Samd9lQ69Z37 1561 aa44,12■■■■■ 4,65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Disp1Q3TDN0 1521 aa44,11■■■■■ 4,65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Efcab5A0JP43 1406 aa44,09■■■■■ 4,65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Setd1bQ8CFT2 1985 aa43,95■■■■■ 4,63
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP43,95■■■■■ 4,63
Gm5601-202ENSMUST00000207161 NrkQ9R0G8 1455 aa43,94■■■■■ 4,62
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43,93■■■■■ 4,62
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Chic1Q8CBW7 227 aa43,9■■■■■ 4,62
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa43,81■■■■■ 4,6
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP43,76■■■■■ 4,6
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rad54l2Q99NG0 1466 aa43,75■■■■■ 4,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Shroom4Q1W617 1475 aa43,72■■■■■ 4,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 PtprkP35822 1457 aa43,71■■■■■ 4,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Magi3Q9EQJ9 1476 aa43,71■■■■■ 4,59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Grin2aP35436 1464 aa43,67■■■■■ 4,58
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Col17a1Q07563 1470 aa43,67■■■■■ 4,58
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Gpatch8A2A6A1 1505 aa43,53■■■■■ 4,56
Gm5601-202ENSMUST00000207161 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43,53■■■■■ 4,56
Gm5601-202ENSMUST00000207161 SynmQ70IV5 1561 aa43,49■■■■■ 4,55
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pla2r1Q62028 1487 aa43,45■■■■■ 4,55
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP43,44■■■■■ 4,54
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP43,3■■■■■ 4,52
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43,3■■■■■ 4,52
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa43,15■■■■■ 4,5
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Zeb1Q64318 1117 aa43,08■■■■■ 4,49
Gm5601-202ENSMUST00000207161 HrcG5E8J6 738 aa43,02■■■■■ 4,48
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Abca16E9PWJ7 1678 aa42,98■■■■■ 4,47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,9 ms