RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207161.1

Gm5601-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm5601, Length 1,437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Kdm5dQ62240 1548 aa52.36■■■■■ 5.97
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51.74■■■■■ 5.87
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50.64■■■■■ 5.7
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48■■■■■ 5.28
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rtl1Q7M732 1744 aa47.76■■■■■ 5.24
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Wdr62Q3U3T8 1523 aa47.73■■■■■ 5.23
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Fam135aQ6NS59 1506 aa47.73■■■■■ 5.23
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Frmpd1A2AKB4 1549 aa47.66■■■■■ 5.22
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa47.17■■■■■ 5.14
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Synj1Q8CHC4 1574 aa47.14■■■■■ 5.14
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ubl4bQ9CQ84 188 aa46.8■■■■■ 5.08
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cux2P70298 1426 aa45.87■■■■■ 4.93
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45.85■■■■■ 4.93
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45.56■■■■■ 4.88
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Top2bQ64511 1612 aa45.49■■■■■ 4.87
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Golga3P55937 1487 aa45.45■■■■■ 4.87
Gm5601-202ENSMUST00000207161 TnnQ80Z71 1560 aa45.4■■■■■ 4.86
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cngb1E1AZ71 1325 aa45.1■■■■■ 4.81
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Crocc2F6XLV1 1638 aa44.73■■■■■ 4.75
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Grin2bQ01097 1482 aa44.4■■■■■ 4.7
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ift140E9PY46 1464 aa44.38■■■■■ 4.69
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Shroom2A2ALU4 1481 aa44.32■■■■■ 4.68
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44.28■■■■■ 4.68
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Rusc2Q80U22 1514 aa44.24■■■■■ 4.67
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Samd9lQ69Z37 1561 aa44.12■■■■■ 4.65
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Disp1Q3TDN0 1521 aa44.11■■■■■ 4.65
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa43.81■■■■■ 4.6
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Shroom4Q1W617 1475 aa43.72■■■■■ 4.59
Gm5601-202ENSMUST00000207161 PtprkP35822 1457 aa43.71■■■■■ 4.59
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Gm5601-202ENSMUST00000207161 Grin2aP35436 1464 aa43.67■■■■■ 4.58
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Col17a1Q07563 1470 aa43.67■■■■■ 4.58
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Gpatch8A2A6A1 1505 aa43.53■■■■■ 4.56
Gm5601-202ENSMUST00000207161 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
Gm5601-202ENSMUST00000207161 SynmQ70IV5 1561 aa43.49■■■■■ 4.55
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pla2r1Q62028 1487 aa43.45■■■■■ 4.55
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43.3■■■■■ 4.52
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa43.15■■■■■ 4.5
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Zeb1Q64318 1117 aa43.08■■■■■ 4.49
Gm5601-202ENSMUST00000207161 HrcG5E8J6 738 aa43.02■■■■■ 4.48
Gm5601-202ENSMUST00000207161 Abca16E9PWJ7 1678 aa42.98■■■■■ 4.47
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