RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086294.10

Ppp1cc-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ppp1cc, Length 1,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa59.96■■■■■ 7.19
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 NischQ80TM9 1593 aa59.25■■■■■ 7.08
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Abcc8B2RUS7 1588 aa57.31■■■■■ 6.76
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Abcc9P70170 1546 aa57.28■■■■■ 6.76
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 ScribQ80U72 1612 aa55.33■■■■■ 6.45
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 NacadQ5SWP3 1504 aa53.56■■■■■ 6.16
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kdm5dQ62240 1548 aa53.49■■■■■ 6.15
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Dcaf1Q80TR8 1506 aa52.58■■■■■ 6.01
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Sycp2Q9CUU3 1500 aa52.53■■■■■ 6
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 BicraF8VPZ9 1578 aa51.85■■■■■ 5.89
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51.62■■■■■ 5.85
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rhox8Q6VSS7 320 aa51.27■■■■■ 5.8
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Baz1aO88379 1555 aa50.86■■■■■ 5.73
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa50.78■■■■■ 5.72
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ccdc180J3QNE4 1664 aa50.68■■■■■ 5.7
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Crybg2B7ZCC2 1516 aa50.63■■■■■ 5.7
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP49.97■■■■■ 5.59
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP49.89■■■■■ 5.58
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa49.38■■■■■ 5.5
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Smarca2Q6DIC0 1577 aa49.35■■■■■ 5.49
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ercc6F8VPZ5 1481 aa49.31■■■■■ 5.48
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa49.23■■■■■ 5.47
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa49.19■■■■■ 5.46
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Fam135aQ6NS59 1506 aa48.82■■■■■ 5.41
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Wdr62Q3U3T8 1523 aa48.78■■■■■ 5.4
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Frmpd1A2AKB4 1549 aa48.76■■■■■ 5.4
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rtl1Q7M732 1744 aa48.4■■■■■ 5.34
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 CftrP26361 1476 aa48.18■■■■■ 5.3
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ubl4bQ9CQ84 188 aa48.17■■■■■ 5.3
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Baz1bQ9Z277 1479 aa48.1■■■■■ 5.29
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Synj1Q8CHC4 1574 aa48.07■■■■■ 5.29
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Unc13aQ4KUS2 1712 aa48.05■■■■■ 5.28
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa48.05■■■■■ 5.28
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa48.04■■■■■ 5.28
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Mrc2Q64449 1479 aa47.71■■■■■ 5.23
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Trim41Q5NCC3 630 aa47.18■■■■■ 5.14
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kif15Q6P9L6 1387 aa47.03■■■■■ 5.12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cux2P70298 1426 aa47.02■■■■■ 5.12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Lamc3Q9R0B6 1581 aa46.75■■■■■ 5.07
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46.69■■■■■ 5.06
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kif21aQ9QXL2 1672 aa46.63■■■■■ 5.05
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cep164Q5DU05 1446 aa46.31■■■■■ 5
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Golga3P55937 1487 aa46.29■■■■■ 5
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cngb1E1AZ71 1325 aa46.24■■■■■ 4.99
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Top2bQ64511 1612 aa46.21■■■■■ 4.99
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Il27Q8K3I6 234 aa46.17■■■■■ 4.98
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 TnnQ80Z71 1560 aa46.17■■■■■ 4.98
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ccdc18Q640L5 1455 aa46.07■■■■■ 4.97
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Dnajc5P60904 198 aa45.94■■■■■ 4.94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Camsap1A2AHC3 1581 aa45.91■■■■■ 4.94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Plb1Q3TTY0 1478 aa45.89■■■■■ 4.94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Fmn1Q05860 1466 aa45.76■■■■■ 4.92
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Crocc2F6XLV1 1638 aa45.72■■■■■ 4.91
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Shroom2A2ALU4 1481 aa45.47■■■■■ 4.87
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Duox2A2AQ99 1517 aa45.41■■■■■ 4.86
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ift140E9PY46 1464 aa45.4■■■■■ 4.86
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Grin2bQ01097 1482 aa45.3■■■■■ 4.84
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rusc2Q80U22 1514 aa45.24■■■■■ 4.83
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Disp1Q3TDN0 1521 aa45.13■■■■■ 4.82
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa45.11■■■■■ 4.81
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Samd9lQ69Z37 1561 aa45.03■■■■■ 4.8
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Efcab5A0JP43 1406 aa45.01■■■■■ 4.8
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Col17a1Q07563 1470 aa44.92■■■■■ 4.78
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Setd1bQ8CFT2 1985 aa44.87■■■■■ 4.77
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Chic1Q8CBW7 227 aa44.84■■■■■ 4.77
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rad54l2Q99NG0 1466 aa44.82■■■■■ 4.77
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa44.82■■■■■ 4.76
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 NrkQ9R0G8 1455 aa44.75■■■■■ 4.75
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Grin2aP35436 1464 aa44.63■■■■■ 4.74
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 PtprkP35822 1457 aa44.62■■■■■ 4.73
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Magi3Q9EQJ9 1476 aa44.62■■■■■ 4.73
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Shroom4Q1W617 1475 aa44.55■■■■■ 4.72
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Fgd6Q69ZL1 1399 aa44.4■■■■■ 4.7
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Pla2r1Q62028 1487 aa44.36■■■■■ 4.69
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 SynmQ70IV5 1561 aa44.34■■■■■ 4.69
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Zeb1Q64318 1117 aa44.29■■■■■ 4.68
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Gpatch8A2A6A1 1505 aa44.17■■■■■ 4.66
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 AknaQ80VW7 1404 aa44.13■■■■■ 4.65
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa44.06■■■■■ 4.64
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Npm2Q80W85 207 aa44.05■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.3 ms