RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086294.10

Ppp1cc-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ppp1cc, Length 1,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Abcc9P70170 1546 aa57,28■■■■■ 6,76
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kdm5dQ62240 1548 aa53,49■■■■■ 6,15
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Dcaf1Q80TR8 1506 aa52,58■■■■■ 6,01
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51,62■■■■■ 5,85
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Trim41Q5NCC3 630 aa47,18■■■■■ 5,14
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP47,06■■■■■ 5,12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kif15Q6P9L6 1387 aa47,03■■■■■ 5,12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Cux2P70298 1426 aa47,02■■■■■ 5,12
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Lamc3Q9R0B6 1581 aa46,75■■■■■ 5,07
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46,69■■■■■ 5,06
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Kif21aQ9QXL2 1672 aa46,63■■■■■ 5,05
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Top2bQ64511 1612 aa46,21■■■■■ 4,99
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP45,94■■■■■ 4,94
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Plb1Q3TTY0 1478 aa45,89■■■■■ 4,94
Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Fmn1Q05860 1466 aa45,76■■■■■ 4,92
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Ift140E9PY46 1464 aa45,4■■■■■ 4,86
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rusc2Q80U22 1514 aa45,24■■■■■ 4,83
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Rad54l2Q99NG0 1466 aa44,82■■■■■ 4,77
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44,38■■■■■ 4,69
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Zeb1Q64318 1117 aa44,29■■■■■ 4,68
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Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 Npm2Q80W85 207 aa44,05■■■■■ 4,64
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