RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000213960.1

Chrna5-202, Transcript of Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Chrna5, Length 1,737 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa59,48■■■■■ 7,11
Chrna5-202ENSMUST00000213960 NischQ80TM9 1593 aa58,63■■■■■ 6,98
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Abcc9P70170 1546 aa56,73■■■■■ 6,67
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Abcc8B2RUS7 1588 aa56,72■■■■■ 6,67
Chrna5-202ENSMUST00000213960 ScribQ80U72 1612 aa54,76■■■■■ 6,36
Chrna5-202ENSMUST00000213960 NacadQ5SWP3 1504 aa53,06■■■■■ 6,08
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Kdm5dQ62240 1548 aa52,93■■■■■ 6,06
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Dcaf1Q80TR8 1506 aa52,18■■■■■ 5,94
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Sycp2Q9CUU3 1500 aa52,01■■■■■ 5,92
Chrna5-202ENSMUST00000213960 BicraF8VPZ9 1578 aa51,29■■■■■ 5,8
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51,1■■■■■ 5,77
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rhox8Q6VSS7 320 aa50,51■■■■■ 5,68
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ccdc180J3QNE4 1664 aa50,38■■■■■ 5,66
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Baz1aO88379 1555 aa50,37■■■■■ 5,65
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Crybg2B7ZCC2 1516 aa50,23■■■■■ 5,63
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa50,02■■■■■ 5,6
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP49,94■■■■■ 5,58
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP49,64■■■■■ 5,54
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP49,54■■■■■ 5,52
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP49,42■■■■■ 5,5
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48,96■■■■■ 5,43
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ercc6F8VPZ5 1481 aa48,88■■■■■ 5,41
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Smarca2Q6DIC0 1577 aa48,87■■■■■ 5,41
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa48,75■■■■■ 5,39
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48,73■■■■■ 5,39
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa48,71■■■■■ 5,39
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Fam135aQ6NS59 1506 aa48,4■■■■■ 5,34
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Wdr62Q3U3T8 1523 aa48,32■■■■■ 5,33
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Frmpd1A2AKB4 1549 aa48,24■■■■■ 5,31
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP48,04■■■■■ 5,28
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rtl1Q7M732 1744 aa48,02■■■■■ 5,28
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Baz1bQ9Z277 1479 aa47,91■■■■■ 5,26
Chrna5-202ENSMUST00000213960 CftrP26361 1476 aa47,65■■■■■ 5,22
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa47,62■■■■■ 5,21
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ubl4bQ9CQ84 188 aa47,59■■■■■ 5,21
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Unc13aQ4KUS2 1712 aa47,58■■■■■ 5,21
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Synj1Q8CHC4 1574 aa47,52■■■■■ 5,2
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP47,52■■■■■ 5,2
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa47,28■■■■■ 5,16
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Mrc2Q64449 1479 aa47,27■■■■■ 5,16
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP46,81■■■■■ 5,08
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Trim41Q5NCC3 630 aa46,62■■■■■ 5,05
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP46,58■■■■■ 5,05
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cux2P70298 1426 aa46,48■■■■■ 5,03
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Kif15Q6P9L6 1387 aa46,48■■■■■ 5,03
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Lamc3Q9R0B6 1581 aa46,31■■■■■ 5
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46,24■■■■■ 4,99
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Kif21aQ9QXL2 1672 aa46,15■■■■■ 4,98
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP46■■■■■ 4,95
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cep164Q5DU05 1446 aa45,86■■■■■ 4,93
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Golga3P55937 1487 aa45,78■■■■■ 4,92
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Top2bQ64511 1612 aa45,76■■■■■ 4,92
Chrna5-202ENSMUST00000213960 TnnQ80Z71 1560 aa45,74■■■■■ 4,91
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ccdc18Q640L5 1455 aa45,64■■■■■ 4,9
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45,6■■■■■ 4,89
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cngb1E1AZ71 1325 aa45,56■■■■■ 4,88
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP45,5■■■■■ 4,87
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Il27Q8K3I6 234 aa45,49■■■■■ 4,87
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Camsap1A2AHC3 1581 aa45,46■■■■■ 4,87
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Dnajc5P60904 198 aa45,45■■■■■ 4,87
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP45,43■■■■■ 4,86
Chrna5-202ENSMUST00000213960 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP45,42■■■■■ 4,86
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Plb1Q3TTY0 1478 aa45,36■■■■■ 4,85
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Fmn1Q05860 1466 aa45,31■■■■■ 4,84
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Crocc2F6XLV1 1638 aa45,29■■■■■ 4,84
Chrna5-202ENSMUST00000213960 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP45,14■■■■■ 4,82
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Shroom2A2ALU4 1481 aa45,11■■■■■ 4,81
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ift140E9PY46 1464 aa45■■■■■ 4,79
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Duox2A2AQ99 1517 aa44,91■■■■■ 4,78
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rusc2Q80U22 1514 aa44,85■■■■■ 4,77
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Grin2bQ01097 1482 aa44,83■■■■■ 4,77
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44,63■■■■■ 4,73
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Disp1Q3TDN0 1521 aa44,62■■■■■ 4,73
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Efcab5A0JP43 1406 aa44,57■■■■■ 4,72
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Samd9lQ69Z37 1561 aa44,54■■■■■ 4,72
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP44,49■■■■■ 4,71
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44,48■■■■■ 4,71
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Col17a1Q07563 1470 aa44,47■■■■■ 4,71
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP44,45■■■■■ 4,71
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa44,41■■■■■ 4,7
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Setd1bQ8CFT2 1985 aa44,4■■■■■ 4,7
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44,39■■■■■ 4,7
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44,33■■■■■ 4,69
Chrna5-202ENSMUST00000213960 NrkQ9R0G8 1455 aa44,31■■■■■ 4,68
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Rad54l2Q99NG0 1466 aa44,24■■■■■ 4,67
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Grin2aP35436 1464 aa44,17■■■■■ 4,66
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Magi3Q9EQJ9 1476 aa44,14■■■■■ 4,66
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Chic1Q8CBW7 227 aa44,13■■■■■ 4,65
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Shroom4Q1W617 1475 aa44,09■■■■■ 4,65
Chrna5-202ENSMUST00000213960 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP44,08■■■■■ 4,65
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44,08■■■■■ 4,65
Chrna5-202ENSMUST00000213960 PtprkP35822 1457 aa44,01■■■■■ 4,64
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43,95■■■■■ 4,63
Chrna5-202ENSMUST00000213960 SynmQ70IV5 1561 aa43,91■■■■■ 4,62
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Gpatch8A2A6A1 1505 aa43,9■■■■■ 4,62
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Pla2r1Q62028 1487 aa43,87■■■■■ 4,61
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Zeb1Q64318 1117 aa43,7■■■■■ 4,59
Chrna5-202ENSMUST00000213960 AknaQ80VW7 1404 aa43,61■■■■■ 4,57
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa43,61■■■■■ 4,57
Chrna5-202ENSMUST00000213960 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43,6■■■■■ 4,57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 6,9 ms