RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109523.1

Vstm2l-201, Transcript of V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Vstm2l, Length 1,363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa60,29■■■■■ 7,24
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 NischQ80TM9 1593 aa59,25■■■■■ 7,08
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Abcc8B2RUS7 1588 aa57,37■■■■■ 6,77
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Abcc9P70170 1546 aa57,3■■■■■ 6,76
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 ScribQ80U72 1612 aa55,61■■■■■ 6,49
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 NacadQ5SWP3 1504 aa53,77■■■■■ 6,2
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Kdm5dQ62240 1548 aa53,66■■■■■ 6,18
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Sycp2Q9CUU3 1500 aa52,73■■■■■ 6,03
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Dcaf1Q80TR8 1506 aa52,7■■■■■ 6,03
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 BicraF8VPZ9 1578 aa52,08■■■■■ 5,93
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51,64■■■■■ 5,86
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa51,34■■■■■ 5,81
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ccdc180J3QNE4 1664 aa50,88■■■■■ 5,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Baz1aO88379 1555 aa50,86■■■■■ 5,73
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rhox8Q6VSS7 320 aa50,72■■■■■ 5,71
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Crybg2B7ZCC2 1516 aa50,7■■■■■ 5,71
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP50,69■■■■■ 5,71
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP50,47■■■■■ 5,67
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP50,15■■■■■ 5,62
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP50,13■■■■■ 5,62
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ercc6F8VPZ5 1481 aa49,66■■■■■ 5,54
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa49,64■■■■■ 5,54
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP49,61■■■■■ 5,53
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Smarca2Q6DIC0 1577 aa49,56■■■■■ 5,52
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa49,4■■■■■ 5,5
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa49,27■■■■■ 5,48
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Fam135aQ6NS59 1506 aa49,24■■■■■ 5,47
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Wdr62Q3U3T8 1523 aa49,03■■■■■ 5,44
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Frmpd1A2AKB4 1549 aa48,93■■■■■ 5,42
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP48,74■■■■■ 5,39
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Baz1bQ9Z277 1479 aa48,68■■■■■ 5,38
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Unc13aQ4KUS2 1712 aa48,38■■■■■ 5,34
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rtl1Q7M732 1744 aa48,38■■■■■ 5,34
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ubl4bQ9CQ84 188 aa48,27■■■■■ 5,32
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa48,16■■■■■ 5,3
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 CftrP26361 1476 aa48,11■■■■■ 5,29
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Mrc2Q64449 1479 aa48,07■■■■■ 5,29
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Synj1Q8CHC4 1574 aa48■■■■■ 5,27
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP47,9■■■■■ 5,26
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa47,54■■■■■ 5,2
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP47,21■■■■■ 5,15
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP47,12■■■■■ 5,13
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa47,11■■■■■ 5,13
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cux2P70298 1426 aa47,1■■■■■ 5,13
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Kif15Q6P9L6 1387 aa47,04■■■■■ 5,12
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Trim41Q5NCC3 630 aa46,93■■■■■ 5,1
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Kif21aQ9QXL2 1672 aa46,92■■■■■ 5,1
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Lamc3Q9R0B6 1581 aa46,84■■■■■ 5,09
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Dnajc5P60904 198 aa46,7■■■■■ 5,07
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP46,56■■■■■ 5,04
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP46,44■■■■■ 5,02
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cep164Q5DU05 1446 aa46,42■■■■■ 5,02
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 TnnQ80Z71 1560 aa46,22■■■■■ 4,99
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ccdc18Q640L5 1455 aa46,15■■■■■ 4,98
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Top2bQ64511 1612 aa46,13■■■■■ 4,97
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP46,1■■■■■ 4,97
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46,08■■■■■ 4,97
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Golga3P55937 1487 aa46,05■■■■■ 4,96
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Shroom2A2ALU4 1481 aa46,03■■■■■ 4,96
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Il27Q8K3I6 234 aa46■■■■■ 4,95
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Plb1Q3TTY0 1478 aa45,99■■■■■ 4,95
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Camsap1A2AHC3 1581 aa45,97■■■■■ 4,95
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Crocc2F6XLV1 1638 aa45,94■■■■■ 4,94
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP45,92■■■■■ 4,94
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cngb1E1AZ71 1325 aa45,84■■■■■ 4,93
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Fmn1Q05860 1466 aa45,64■■■■■ 4,9
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP45,63■■■■■ 4,9
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ift140E9PY46 1464 aa45,61■■■■■ 4,89
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rusc2Q80U22 1514 aa45,56■■■■■ 4,88
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP45,45■■■■■ 4,87
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Col17a1Q07563 1470 aa45,43■■■■■ 4,86
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Duox2A2AQ99 1517 aa45,41■■■■■ 4,86
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Grin2bQ01097 1482 aa45,26■■■■■ 4,84
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Disp1Q3TDN0 1521 aa45,18■■■■■ 4,82
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP45,14■■■■■ 4,82
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP45,14■■■■■ 4,82
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Setd1bQ8CFT2 1985 aa45,14■■■■■ 4,82
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Samd9lQ69Z37 1561 aa45,11■■■■■ 4,81
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP45,02■■■■■ 4,8
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44,98■■■■■ 4,79
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa44,98■■■■■ 4,79
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Efcab5A0JP43 1406 aa44,98■■■■■ 4,79
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Rad54l2Q99NG0 1466 aa44,75■■■■■ 4,75
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Grin2aP35436 1464 aa44,71■■■■■ 4,75
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44,69■■■■■ 4,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44,69■■■■■ 4,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Magi3Q9EQJ9 1476 aa44,67■■■■■ 4,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP44,66■■■■■ 4,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 NrkQ9R0G8 1455 aa44,66■■■■■ 4,74
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Fgd6Q69ZL1 1399 aa44,55■■■■■ 4,72
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Shroom4Q1W617 1475 aa44,45■■■■■ 4,71
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Gpatch8A2A6A1 1505 aa44,44■■■■■ 4,7
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Adgrl3Q80TS3 1537 aa44,42■■■■■ 4,7
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 PtprkP35822 1457 aa44,39■■■■■ 4,7
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Cep170Q6A065 1588 aa44,39■■■■■ 4,7
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 SynmQ70IV5 1561 aa44,38■■■■■ 4,69
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Pla2r1Q62028 1487 aa44,37■■■■■ 4,69
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa44,34■■■■■ 4,69
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Chic1Q8CBW7 227 aa44,31■■■■■ 4,68
Vstm2l-201ENSMUST00000109523 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa44,27■■■■■ 4,68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,7 ms