RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000163716.2

Apcdd1-202, Transcript of Protein APCDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Apcdd1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 NischQ80TM9 1593 aa50,73■■■■■ 5,71
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa50,36■■■■■ 5,65
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Abcc9P70170 1546 aa49,33■■■■■ 5,49
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,31■■■■■ 5,32
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,17■■■■■ 4,98
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rtl1Q7M732 1744 aa45,94■■■■■ 4,94
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45,33■■■■■ 4,85
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 ScribQ80U72 1612 aa45,14■■■■■ 4,82
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44,79■■■■■ 4,76
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,42■■■■■ 4,7
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Kdm5dQ62240 1548 aa44,27■■■■■ 4,68
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 NacadQ5SWP3 1504 aa44,15■■■■■ 4,66
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Baz1aO88379 1555 aa43,99■■■■■ 4,63
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43,94■■■■■ 4,62
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,5■■■■■ 4,55
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43,13■■■■■ 4,49
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,93■■■■■ 4,46
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,73■■■■■ 4,43
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 HrcG5E8J6 738 aa42,62■■■■■ 4,41
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Trim41Q5NCC3 630 aa42,37■■■■■ 4,37
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 BicraF8VPZ9 1578 aa42,06■■■■■ 4,32
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,94■■■■■ 4,31
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41,69■■■■■ 4,26
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cep164Q5DU05 1446 aa41,49■■■■■ 4,23
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,41■■■■■ 4,22
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa41,32■■■■■ 4,2
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 CftrP26361 1476 aa41,27■■■■■ 4,2
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Golga3P55937 1487 aa41,26■■■■■ 4,2
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,24■■■■■ 4,19
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,22■■■■■ 4,19
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,04■■■■■ 4,16
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Top2bQ64511 1612 aa40,9■■■■■ 4,14
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,89■■■■■ 4,14
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,78■■■■■ 4,12
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,65■■■■■ 4,1
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40,64■■■■■ 4,1
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP40,64■■■■■ 4,1
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Chic1Q8CBW7 227 aa40,63■■■■■ 4,09
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,61■■■■■ 4,09
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP40,55■■■■■ 4,08
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Fmn1Q05860 1466 aa40,35■■■■■ 4,05
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,32■■■■■ 4,05
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP40,22■■■■■ 4,03
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Gab3Q8BSM5 595 aa40,13■■■■■ 4,01
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40,02■■■■■ 4
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,91■■■■□ 3,98
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 TnnQ80Z71 1560 aa39,82■■■■□ 3,97
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,81■■■■□ 3,96
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39,81■■■■□ 3,96
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ercc6F8VPZ5 1481 aa39,79■■■■□ 3,96
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,56■■■■□ 3,92
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cep162Q6ZQ06 1403 aa39,42■■■■□ 3,9
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39,38■■■■□ 3,89
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP39,25■■■■□ 3,87
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,23■■■■□ 3,87
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP39,22■■■■□ 3,87
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Npm2Q80W85 207 aa39,15■■■■□ 3,86
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,12■■■■□ 3,85
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39,11■■■■□ 3,85
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 NrkQ9R0G8 1455 aa39,05■■■■□ 3,84
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,04■■■■□ 3,84
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Shroom4Q1W617 1475 aa38,93■■■■□ 3,82
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Myt1lP97500 1187 aa38,9■■■■□ 3,82
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 NefmP08553 848 aa38,89■■■■□ 3,82
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38,87■■■■□ 3,81
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Fam135aQ6NS59 1506 aa38,86■■■■□ 3,81
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Map3k1P53349 1493 aa38,83■■■■□ 3,81
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Grin2bQ01097 1482 aa38,81■■■■□ 3,8
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 PtprkP35822 1457 aa38,79■■■■□ 3,8
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Mier1Q5UAK0 511 aa38,76■■■■□ 3,8
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Clip1Q922J3 1391 aa38,72■■■■□ 3,79
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Il27Q8K3I6 234 aa38,71■■■■□ 3,79
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Cux2P70298 1426 aa38,65■■■■□ 3,78
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38,61■■■■□ 3,77
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Baz1bQ9Z277 1479 aa38,6■■■■□ 3,77
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Eea1Q8BL66 1411 aa38,56■■■■□ 3,76
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38,52■■■■□ 3,76
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,48■■■■□ 3,75
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 UbtfP25976 765 aaKnown RBP38,48■■■■□ 3,75
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38,48■■■■□ 3,75
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Efcab5A0JP43 1406 aa38,46■■■■□ 3,75
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38,39■■■■□ 3,74
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,34■■■■□ 3,73
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Pcgf6Q99NA9 353 aa38,32■■■■□ 3,73
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa38,3■■■■□ 3,72
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Zeb1Q64318 1117 aa38,3■■■■□ 3,72
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Arap1Q4LDD4 1452 aa38,29■■■■□ 3,72
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Setd5Q5XJV7 1441 aa38,29■■■■□ 3,72
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Erich3F6QRE9 1637 aa38,29■■■■□ 3,72
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Duox2A2AQ99 1517 aa38,22■■■■□ 3,71
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38,17■■■■□ 3,7
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa38,14■■■■□ 3,7
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ankrd26Q811D2 1581 aa38,13■■■■□ 3,69
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Tiam1Q60610 1591 aa38,09■■■■□ 3,69
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa38,07■■■■□ 3,68
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 SynmQ70IV5 1561 aa38,02■■■■□ 3,68
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38,02■■■■□ 3,68
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Mrc2Q64449 1479 aa37,98■■■■□ 3,67
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP37,97■■■■□ 3,67
Apcdd1-202ENSMUST00000163716 Samd9lQ69Z37 1561 aa37,92■■■■□ 3,66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,3 ms