Protein–RNA interactions for Protein: O15172

PSPHP1, Putative phosphoserine phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP1O15172 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP1O15172 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSPHP1O15172 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSPHP1O15172 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSPHP1O15172 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSPHP1O15172 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPHP1O15172 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms