Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9Y3F1 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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