Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms