Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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