Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms