Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCB6Q9NP58 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms