Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6P435 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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