Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms