Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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