Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms