Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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