Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI2P48788 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms