Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H1P32780 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms