Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YY1P25490 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 MIA-201ENST00000263369 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 MIA-203ENST00000594436 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YY1P25490 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
YY1P25490 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms