Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms