Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms