Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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