Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ASXL3Q9C0F0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms