Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLF1Q9BQI6 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms