Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6P435 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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