Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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