Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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