Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDCD2Q16342 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDCD2Q16342 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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