Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms