Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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USP46P62068 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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USP46P62068 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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USP46P62068 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP46P62068 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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USP46P62068 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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USP46P62068 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP46P62068 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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