Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ACTBP60709 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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