Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NESP48681 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NESP48681 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms