Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT1P21579 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT1P21579 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms