Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIG1P18858 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms