Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF4P18085 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF4P18085 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF4P18085 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms