Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GATA1P15976 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GATA1P15976 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms